More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2059 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  100 
 
 		 313 aa  634    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  63.7 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  60.45 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  60.45 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  59.49 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  58.06 
 
 		 313 aa  353  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  59.03 
 
 		 311 aa  352  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  53.21 
 
 		 311 aa  351  8e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  56.38 
 
 		 306 aa  347  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  54.05 
 
 		 312 aa  343  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  57.88 
 
 		 318 aa  342  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  52.58 
 
 		 310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  52.58 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  56.31 
 
 		 308 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  55.89 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  57.23 
 
 		 313 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  56.23 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  54.69 
 
 		 314 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  54.49 
 
 		 312 aa  325  6e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  53.49 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  52.43 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  52.49 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  50.65 
 
 		 315 aa  318  5e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  52.19 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  50.16 
 
 		 327 aa  316  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  50.32 
 
 		 313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  51.46 
 
 		 311 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  50.5 
 
 		 305 aa  311  7.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  52.9 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  49.03 
 
 		 326 aa  308  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  48.7 
 
 		 327 aa  308  8e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  48.7 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  48.71 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  47.42 
 
 		 314 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  49.03 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  47.57 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  47.08 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  47.59 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  46.91 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  46.52 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  48.72 
 
 		 322 aa  292  5e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  46.91 
 
 		 317 aa  288  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  45.28 
 
 		 317 aa  288  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  47.23 
 
 		 320 aa  285  5e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  46.58 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  43.51 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  48.38 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  45.4 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  45.45 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  45.28 
 
 		 312 aa  275  9e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  48.36 
 
 		 319 aa  275  9e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  46.91 
 
 		 317 aa  272  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  44.95 
 
 		 592 aa  263  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  44.44 
 
 		 336 aa  262  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  44.12 
 
 		 319 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  42.58 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  42.27 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  42.68 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  42.49 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  43.18 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  44.55 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  39.27 
 
 		 338 aa  232  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  40.92 
 
 		 317 aa  232  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  40.2 
 
 		 313 aa  231  9e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  42.17 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  39.48 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  37.91 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  39.22 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  40.66 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  40.26 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  39.22 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  42.18 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  37.86 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  36.96 
 
 		 323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  37.91 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  35.74 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  38.24 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  38.96 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  38.24 
 
 		 317 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  38.24 
 
 		 317 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  37.62 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  38.24 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  38.24 
 
 		 317 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  42.17 
 
 		 614 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  39.16 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  36.27 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  37.62 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  37.62 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  41.4 
 
 		 624 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  40.5 
 
 		 339 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  37.37 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  37.46 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  38.83 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  38.13 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  37.58 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  35.74 
 
 		 347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  38.69 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  37.37 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  37.37 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  39.25 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>