More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1997 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  100 
 
 		 321 aa  643    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  72.67 
 
 		 325 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  74.36 
 
 		 315 aa  455  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  49.84 
 
 		 317 aa  318  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  59.74 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  52.43 
 
 		 313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  47.25 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  49.01 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  47.12 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  46.47 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  48.86 
 
 		 312 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  48.38 
 
 		 313 aa  296  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  46.79 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  46.44 
 
 		 315 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  46.6 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  48.21 
 
 		 310 aa  292  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  53.74 
 
 		 311 aa  292  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  45.83 
 
 		 327 aa  292  6e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  47.12 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  47.88 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  45.51 
 
 		 327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  45.6 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  45.63 
 
 		 322 aa  285  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  46.71 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  46.6 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  48.21 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  48.06 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  48.06 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  46.93 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  52.43 
 
 		 311 aa  283  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  44.66 
 
 		 318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  48.34 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  53.09 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  53.07 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  50.81 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  51.47 
 
 		 314 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  44.3 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  44.34 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  45.63 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  45.63 
 
 		 317 aa  275  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  53.4 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  44.77 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  46.43 
 
 		 313 aa  273  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  43.95 
 
 		 324 aa  268  7e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  44.12 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  43.04 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  43.46 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  43.32 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  46.1 
 
 		 317 aa  262  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  49.84 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  43.32 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  46.62 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  44.52 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  41.72 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  41.1 
 
 		 310 aa  232  8.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  40.26 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  40.52 
 
 		 342 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  44 
 
 		 592 aa  222  6e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  40.66 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  38.91 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  43.82 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  41.03 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  41.72 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  42.33 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  38.19 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  34.82 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  41.55 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  40.58 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  41.03 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  39.6 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  40.67 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  38.41 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  39.35 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  35.64 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  39.45 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  41.08 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  35.97 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  35.97 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  41.41 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  35.97 
 
 		 317 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  35.97 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  35.97 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  42.09 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  37.3 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  37.94 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  37.3 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  38.34 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  36.45 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  37.1 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  39.93 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  37.79 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  37.46 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  38.46 
 
 		 342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  38.39 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  37.66 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  33.9 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  36.74 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  36.36 
 
 		 689 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  35.86 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  35.69 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>