More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1381 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  100 
 
 
306 aa  623  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  60.4 
 
 
306 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  58 
 
 
314 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  58 
 
 
314 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  56.25 
 
 
310 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  56.25 
 
 
310 aa  350  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  55.92 
 
 
312 aa  348  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  58.59 
 
 
313 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  56.38 
 
 
313 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  55.33 
 
 
305 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  56.71 
 
 
321 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  55.82 
 
 
311 aa  334  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  57.67 
 
 
311 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  52.17 
 
 
311 aa  334  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  57.67 
 
 
311 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  51.85 
 
 
317 aa  329  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  59.4 
 
 
313 aa  324  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  55.67 
 
 
314 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  54.55 
 
 
312 aa  321  9.000000000000001e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  53.77 
 
 
312 aa  321  9.000000000000001e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  53.44 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  53.44 
 
 
312 aa  318  7e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  55.59 
 
 
318 aa  317  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  51.96 
 
 
314 aa  317  1e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  55.67 
 
 
308 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  54.3 
 
 
311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  50.33 
 
 
317 aa  309  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  49.83 
 
 
327 aa  308  6.999999999999999e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  49.33 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  54.33 
 
 
314 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  50.5 
 
 
327 aa  305  6e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  50.5 
 
 
326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  49.34 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  51.32 
 
 
317 aa  301  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  50.17 
 
 
327 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  47.35 
 
 
315 aa  300  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  50.5 
 
 
327 aa  299  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  50.17 
 
 
320 aa  298  6e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  49.5 
 
 
326 aa  298  9e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  48.97 
 
 
322 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  50.17 
 
 
315 aa  297  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  50 
 
 
317 aa  297  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  47.65 
 
 
320 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  50.17 
 
 
313 aa  294  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  50 
 
 
319 aa  290  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  48.51 
 
 
325 aa  289  3e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  46.65 
 
 
324 aa  290  3e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  49.5 
 
 
317 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  44.63 
 
 
319 aa  275  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  48.34 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  47.39 
 
 
308 aa  271  1e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  45.48 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  46.64 
 
 
319 aa  258  8e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  44.7 
 
 
336 aa  255  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  46.64 
 
 
592 aa  254  9e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  43.81 
 
 
342 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  41.08 
 
 
318 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  42.57 
 
 
310 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  41.56 
 
 
312 aa  246  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  43.18 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  43 
 
 
322 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  41.67 
 
 
317 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  42.07 
 
 
314 aa  235  9e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  41.75 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  42.39 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  40.69 
 
 
318 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  42.86 
 
 
313 aa  231  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  41.45 
 
 
333 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  38.62 
 
 
322 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  41.14 
 
 
314 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  45.19 
 
 
328 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  40.98 
 
 
313 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  42.43 
 
 
340 aa  221  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  38.26 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  41.91 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  38.87 
 
 
338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  41.83 
 
 
348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  40.39 
 
 
337 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  40.73 
 
 
332 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  41.91 
 
 
332 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  39.8 
 
 
332 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  41.75 
 
 
315 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  43.77 
 
 
332 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  43.77 
 
 
332 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  39.39 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  43.4 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  43.4 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  43.4 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  39.67 
 
 
332 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  39.47 
 
 
332 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  36.15 
 
 
323 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  38.89 
 
 
333 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  40.45 
 
 
342 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  40.61 
 
 
333 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  40.69 
 
 
331 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  39.78 
 
 
317 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  40.68 
 
 
339 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  39.78 
 
 
317 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  40.85 
 
 
342 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  40.68 
 
 
339 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>