More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1554 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  96.79 
 
 		 312 aa  615  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  95.51 
 
 		 312 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  83.44 
 
 		 312 aa  535  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  74.11 
 
 		 314 aa  485  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  55.85 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  53.09 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  56.19 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  55.52 
 
 		 310 aa  325  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  51.92 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  57.19 
 
 		 314 aa  322  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  57.19 
 
 		 314 aa  322  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  52.41 
 
 		 311 aa  321  9.000000000000001e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  52.49 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  53.44 
 
 		 306 aa  318  7e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  55.18 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  52.85 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  58.22 
 
 		 314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  53.38 
 
 		 311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  54.15 
 
 		 313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  48.16 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  56.19 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  51 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  52.9 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  46.82 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  46.13 
 
 		 327 aa  281  7.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  48.85 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  48.5 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  46.45 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  47.19 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  46.91 
 
 		 325 aa  278  6e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  46.95 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  46.89 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  47.59 
 
 		 320 aa  276  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  46.25 
 
 		 315 aa  275  7e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  53.44 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  46.13 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  44.95 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  44.84 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  49.84 
 
 		 318 aa  268  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  46.1 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  48.2 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  43.87 
 
 		 327 aa  266  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  46.69 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  47.76 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  45.02 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  45.82 
 
 		 336 aa  262  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  47.04 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  43.23 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  43.32 
 
 		 321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  42.33 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  41.25 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  43.25 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  38.44 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  37.46 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  39.14 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  39.37 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  42.28 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  39.13 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  38.13 
 
 		 314 aa  218  8.999999999999998e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  38.36 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  39.13 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  36.79 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  35.45 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  39.94 
 
 		 592 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  38.46 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  41.31 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  36.79 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  39.74 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  35.71 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  39.48 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  37.13 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  39.54 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  38.61 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  38.46 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  39.46 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  35.62 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  39.1 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  41.2 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  35.12 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  34.78 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  34.11 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  35.79 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  36.48 
 
 		 320 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  33.33 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  35.37 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  35.88 
 
 		 342 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  37.66 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0727  transketolase central region  35.69 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  38.1 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  35.02 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  34.9 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  34.8 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  35.64 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  34.81 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  34.81 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  35.12 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0406  Transketolase central region  36.45 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  34.47 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  34.67 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>