More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2800 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  100 
 
 		 320 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  72.96 
 
 		 320 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  42.35 
 
 		 313 aa  255  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  41.91 
 
 		 318 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  41.24 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  39.02 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  41.38 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  38.85 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  36.39 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  37.46 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  37.46 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  37.79 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  38.26 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  35.47 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  35.67 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  41.72 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  35.76 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  36.48 
 
 		 312 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  37.07 
 
 		 327 aa  205  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  37.22 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  36.81 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  35.86 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  38.96 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  37.75 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  36.48 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  36.73 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  35.95 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  38.11 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  34.88 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  37.75 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  35.23 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  39.4 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  36.72 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  36.39 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  34.69 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  35.37 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  37.17 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  33.89 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  33.77 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  35.97 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  35.71 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  35.71 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  35.37 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  35.37 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  37.05 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  38.98 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  37.1 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1418  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  37.99 
 
 		 646 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793105  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  34.11 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  34.11 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  32.45 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  35.97 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  34.41 
 
 		 592 aa  187  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  34.54 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  32.12 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  37.46 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  32.78 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  35.64 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  36.67 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  38.11 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  35.47 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  35.71 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2448  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  34.31 
 
 		 631 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  36.48 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  35.74 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  36.9 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  34.16 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  33.55 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  33.91 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  34.31 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06530  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  36.6 
 
 		 636 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  37.25 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  33.55 
 
 		 314 aa  176  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  33.99 
 
 		 314 aa  176  7e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  36.81 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  34.43 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  35.29 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  34.74 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  38.78 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4395  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  35.08 
 
 		 635 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  34.36 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  35.08 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  33.22 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  37.41 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4569  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  35.08 
 
 		 635 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  35.62 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  34.78 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  34.78 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  34.65 
 
 		 635 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1852  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  35.83 
 
 		 640 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  35.62 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  33.33 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4532  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.55 
 
 		 635 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  33.9 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  34.11 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  34.11 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  34.11 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  32.18 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  34.3 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  33.8 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>