More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1058 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  39.58 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  42.25 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  39.87 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  41.9 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  40.36 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  38.26 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  39.27 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  40.16 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  40.16 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  42.02 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  44.12 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  44.18 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  44.28 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  37.71 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  43.7 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  43.55 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  45.78 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  45.78 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  41.53 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  35.08 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  40.37 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  44.8 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  41.91 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  44.8 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  42.51 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  42.04 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  40.73 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  44.98 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  38.85 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  36 
 
 		 635 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  39.52 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  44.18 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  38.31 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  40.32 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  41.91 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  38.01 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  38.71 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  35.91 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  41.37 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  39.15 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  34.73 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  35.37 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  39.63 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  40.65 
 
 		 327 aa  178  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  33.23 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  39.53 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  43.6 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  40.73 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  38 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  38.15 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  36.49 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  39.2 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  39.42 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  38.91 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  38.81 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  38.91 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  36.12 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  41.85 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  38.78 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  37.6 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  37.87 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  42.68 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  40.64 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  37.1 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  40.96 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  36.47 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  41.48 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  38.31 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  38.71 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  39.46 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  39.03 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  34.47 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  43.62 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  41.63 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  41.98 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  38.89 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  37.58 
 
 		 339 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  37.46 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  40.73 
 
 		 315 aa  169  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  37.5 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  38.85 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  40.4 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  41.87 
 
 		 314 aa  167  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  43.37 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1027  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  36.69 
 
 		 634 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  41.43 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  36.84 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1398  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  38.93 
 
 		 629 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  33.33 
 
 		 318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1758  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  38.33 
 
 		 633 aa  165  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.805776 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  35.63 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  39.18 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  35.41 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  41.37 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  43.25 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  36.82 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0342  Transketolase domain protein  41.89 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  41.46 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  45.34 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>