More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0268 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0268  transketolase  100 
 
 		 606 aa  1248    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  49.92 
 
 		 624 aa  565  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  49.51 
 
 		 629 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  48.2 
 
 		 621 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  48.69 
 
 		 630 aa  536  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  48.38 
 
 		 626 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  48.81 
 
 		 612 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  48.28 
 
 		 614 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  46.03 
 
 		 627 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  48.38 
 
 		 639 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  45.71 
 
 		 624 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  47.7 
 
 		 622 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  38.54 
 
 		 662 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  34.73 
 
 		 689 aa  300  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  32.16 
 
 		 640 aa  289  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  31.97 
 
 		 592 aa  276  9e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  54.89 
 
 		 271 aa  269  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  31.01 
 
 		 653 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  29.43 
 
 		 631 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  31.14 
 
 		 623 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  51.69 
 
 		 271 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  49.81 
 
 		 272 aa  251  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  29.37 
 
 		 618 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  48.87 
 
 		 271 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  48.88 
 
 		 277 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  50.19 
 
 		 286 aa  243  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  49.05 
 
 		 273 aa  243  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  48.67 
 
 		 282 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  30.38 
 
 		 635 aa  242  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  49.25 
 
 		 276 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  30.38 
 
 		 635 aa  242  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  45.22 
 
 		 274 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  45.22 
 
 		 274 aa  240  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  46.3 
 
 		 281 aa  234  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  46.64 
 
 		 277 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  51.17 
 
 		 275 aa  232  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  46.82 
 
 		 275 aa  231  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  46.59 
 
 		 274 aa  230  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  46.21 
 
 		 274 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  46.04 
 
 		 281 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  49.06 
 
 		 273 aa  228  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  50 
 
 		 279 aa  226  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  48.68 
 
 		 279 aa  226  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  45.25 
 
 		 269 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  30.1 
 
 		 636 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  43.81 
 
 		 319 aa  215  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  41.35 
 
 		 272 aa  213  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  42.75 
 
 		 303 aa  212  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  38.31 
 
 		 311 aa  212  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.28 
 
 		 273 aa  211  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  29.72 
 
 		 632 aa  211  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  45.56 
 
 		 280 aa  211  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  42.11 
 
 		 275 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  41.89 
 
 		 275 aa  209  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  29.41 
 
 		 632 aa  209  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  38.56 
 
 		 312 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  29.37 
 
 		 632 aa  208  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  43.24 
 
 		 275 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  41.73 
 
 		 275 aa  207  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.61 
 
 		 273 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  42.49 
 
 		 303 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  36.6 
 
 		 317 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  46.64 
 
 		 278 aa  204  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  38.82 
 
 		 306 aa  203  7e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  40.58 
 
 		 303 aa  203  8e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  44.53 
 
 		 297 aa  203  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  43.37 
 
 		 284 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  42.45 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  37.66 
 
 		 314 aa  201  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  38.19 
 
 		 327 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  38.56 
 
 		 322 aa  200  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  37.26 
 
 		 327 aa  200  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  42.11 
 
 		 279 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  28.85 
 
 		 634 aa  200  7e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  42.12 
 
 		 309 aa  199  7.999999999999999e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  29.04 
 
 		 648 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  40.53 
 
 		 313 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  36.88 
 
 		 305 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  41.16 
 
 		 318 aa  196  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  40.14 
 
 		 321 aa  196  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  41.35 
 
 		 288 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  36.27 
 
 		 310 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  41.7 
 
 		 270 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  36.83 
 
 		 312 aa  193  9e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  38.97 
 
 		 297 aa  193  9e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  38.51 
 
 		 313 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  35.42 
 
 		 327 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  35.95 
 
 		 310 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  38.81 
 
 		 299 aa  192  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  37.5 
 
 		 324 aa  191  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  39.64 
 
 		 301 aa  191  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  29.78 
 
 		 661 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  37.18 
 
 		 326 aa  190  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  38.95 
 
 		 280 aa  190  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  28.66 
 
 		 636 aa  190  8e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  36.67 
 
 		 306 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  37.22 
 
 		 327 aa  189  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  37.75 
 
 		 327 aa  189  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  36.62 
 
 		 326 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  37.62 
 
 		 311 aa  188  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>