More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1382 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  100 
 
 		 269 aa  552  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  66.42 
 
 		 282 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  62.88 
 
 		 274 aa  361  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  62.88 
 
 		 274 aa  361  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  63.94 
 
 		 273 aa  358  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  63.77 
 
 		 271 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  62.12 
 
 		 272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  60 
 
 		 277 aa  347  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  61.51 
 
 		 281 aa  345  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  60 
 
 		 271 aa  344  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  62.5 
 
 		 271 aa  341  7e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  58.43 
 
 		 279 aa  332  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  60.75 
 
 		 273 aa  331  7.000000000000001e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  59.77 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  59.22 
 
 		 284 aa  319  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  55.07 
 
 		 286 aa  318  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  53.76 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  57.79 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  56.44 
 
 		 277 aa  315  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  57.52 
 
 		 272 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  55.81 
 
 		 281 aa  301  6.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  55.68 
 
 		 274 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  54.15 
 
 		 286 aa  300  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  56.02 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  56.39 
 
 		 275 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  56.02 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  54.92 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  53.96 
 
 		 273 aa  298  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  53.33 
 
 		 275 aa  291  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  53.38 
 
 		 689 aa  289  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  56.3 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  51.11 
 
 		 275 aa  277  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  50.95 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  54.12 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  52.06 
 
 		 279 aa  269  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  47.76 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  50 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.47 
 
 		 555 aa  260  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  48.39 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  48.87 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  45.15 
 
 		 269 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  46.89 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  44.84 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  45.52 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  46.52 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  46.79 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  43.77 
 
 		 311 aa  244  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  46.39 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  45.28 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  46.32 
 
 		 303 aa  241  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  45.15 
 
 		 276 aa  241  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  46.47 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  45.15 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  44.4 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  43.59 
 
 		 303 aa  238  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  42.7 
 
 		 289 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  46.18 
 
 		 624 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  44.94 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  47.74 
 
 		 631 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  44.85 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  42.16 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  46.84 
 
 		 618 aa  230  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  47.81 
 
 		 278 aa  229  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  46.42 
 
 		 623 aa  229  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  44.69 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  42.91 
 
 		 278 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  44.53 
 
 		 281 aa  228  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  45.25 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  46.27 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  39.33 
 
 		 294 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  41.64 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  43.48 
 
 		 285 aa  225  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  43.75 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  45.25 
 
 		 606 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  44.58 
 
 		 277 aa  221  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  42.05 
 
 		 277 aa  221  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  45.32 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  44.91 
 
 		 640 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  44.69 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  44.85 
 
 		 626 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  41.9 
 
 		 291 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  42.81 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  42.48 
 
 		 629 aa  215  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  41.89 
 
 		 630 aa  212  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  43.87 
 
 		 635 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  43.87 
 
 		 635 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  39.48 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  40.74 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  41.27 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  42.07 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  43.23 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  41.51 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  38.75 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  43.7 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  43.32 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  40.87 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  40.87 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  42.86 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  40.87 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  40.87 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>