More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1062 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  53.97 
 
 		 631 aa  694    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  55.71 
 
 		 640 aa  715    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  100 
 
 		 635 aa  1298    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  58.97 
 
 		 618 aa  752    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  100 
 
 		 635 aa  1298    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  61.38 
 
 		 623 aa  766    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  49.45 
 
 		 648 aa  568  1e-161  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  44.95 
 
 		 653 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  30.47 
 
 		 624 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  31.29 
 
 		 626 aa  263  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  30.28 
 
 		 630 aa  263  8e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  30.17 
 
 		 629 aa  260  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  30.02 
 
 		 621 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  31.53 
 
 		 614 aa  253  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  32.28 
 
 		 689 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  30 
 
 		 606 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  29.49 
 
 		 624 aa  232  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  30.41 
 
 		 612 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  29.73 
 
 		 627 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  45.99 
 
 		 281 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  31.66 
 
 		 639 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  45.39 
 
 		 271 aa  218  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  29.12 
 
 		 592 aa  217  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  45.11 
 
 		 282 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  42.65 
 
 		 274 aa  212  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  42.49 
 
 		 274 aa  212  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  43.87 
 
 		 269 aa  211  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  30.09 
 
 		 622 aa  207  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  45.32 
 
 		 273 aa  207  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4061  Transketolase domain protein  29.04 
 
 		 637 aa  207  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  43.23 
 
 		 277 aa  206  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  46 
 
 		 284 aa  203  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  42.5 
 
 		 286 aa  203  9e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  44.07 
 
 		 271 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  43.07 
 
 		 272 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  43.59 
 
 		 275 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  45.02 
 
 		 273 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  42.22 
 
 		 271 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  42.75 
 
 		 279 aa  196  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  40.6 
 
 		 275 aa  195  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  42.6 
 
 		 281 aa  194  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  41.79 
 
 		 272 aa  193  6e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4506  Transketolase domain protein  27.53 
 
 		 637 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  36.92 
 
 		 315 aa  193  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0721  transketolase-like  28.33 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953782  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  41.64 
 
 		 275 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  41.24 
 
 		 273 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  40.89 
 
 		 286 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.46 
 
 		 297 aa  188  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  40.52 
 
 		 275 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  42.01 
 
 		 273 aa  187  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  41.04 
 
 		 275 aa  187  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.07 
 
 		 274 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  39.11 
 
 		 276 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  40.15 
 
 		 277 aa  183  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  39.71 
 
 		 274 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  27.9 
 
 		 679 aa  180  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  39.04 
 
 		 301 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  36.42 
 
 		 306 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  29.41 
 
 		 662 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  30.1 
 
 		 660 aa  174  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  27.01 
 
 		 666 aa  173  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0851  transketolase  26.68 
 
 		 660 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  39.02 
 
 		 275 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  26.56 
 
 		 666 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  29.9 
 
 		 661 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00040  transketolase, putative  27.73 
 
 		 673 aa  172  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.214798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  27.96 
 
 		 667 aa  170  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  38.06 
 
 		 288 aa  170  8e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  35.02 
 
 		 321 aa  170  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  38.41 
 
 		 303 aa  169  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  27.04 
 
 		 636 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  39.46 
 
 		 273 aa  168  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  37.59 
 
 		 297 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  25.91 
 
 		 660 aa  167  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  26.48 
 
 		 661 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  36.52 
 
 		 297 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  29.05 
 
 		 634 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  26.26 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  26.26 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  27.55 
 
 		 663 aa  165  3e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  38.02 
 
 		 280 aa  165  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  26.22 
 
 		 656 aa  165  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  34.17 
 
 		 310 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  32.92 
 
 		 312 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  35.15 
 
 		 303 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  36.12 
 
 		 270 aa  164  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  27.41 
 
 		 665 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  36.84 
 
 		 285 aa  163  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  26.59 
 
 		 671 aa  163  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  33.86 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  39.63 
 
 		 279 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  38.38 
 
 		 280 aa  161  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  37.45 
 
 		 303 aa  162  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  33.23 
 
 		 317 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  37.07 
 
 		 263 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  26.44 
 
 		 682 aa  160  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  29.05 
 
 		 671 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  26.86 
 
 		 632 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  27.26 
 
 		 632 aa  159  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>