More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1192 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  100 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  77.74 
 
 		 303 aa  488  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  78.26 
 
 		 305 aa  475  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  73.91 
 
 		 303 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  71.57 
 
 		 303 aa  455  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  71.48 
 
 		 297 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  74.58 
 
 		 303 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  55.28 
 
 		 280 aa  295  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  50.72 
 
 		 281 aa  271  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  52.17 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  50.55 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  49.82 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  51.55 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  48.94 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  49.08 
 
 		 271 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  51.99 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  48.97 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  47.08 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  48.03 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  48.96 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  46.55 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  48 
 
 		 275 aa  252  6e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  46.18 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  48.18 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  46.18 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  47.1 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  45.76 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  47.83 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  48.94 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  51.12 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  46.67 
 
 		 274 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  46.67 
 
 		 274 aa  248  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  46.62 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  45.42 
 
 		 275 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  42.86 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  47.81 
 
 		 278 aa  239  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  43.96 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  47.43 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.97 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  44.85 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  44.53 
 
 		 274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  44 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  43.66 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  46.18 
 
 		 689 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  45.63 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  41.43 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  47.08 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  43.86 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  40.07 
 
 		 265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  41.76 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  44 
 
 		 279 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  41.04 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  40.16 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.18 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  38.69 
 
 		 618 aa  193  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  40.45 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  41.35 
 
 		 280 aa  191  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  39.71 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  39.19 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  42.28 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.57 
 
 		 555 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  39.71 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  41.52 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  39.64 
 
 		 606 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  40.78 
 
 		 279 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  37.01 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  39.63 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  40.24 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  39.58 
 
 		 287 aa  188  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  39.69 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  35.67 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  37.94 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  39.02 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  41.77 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  40.15 
 
 		 623 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  37.78 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  40.32 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  37.99 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  37.46 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  39.92 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  38.35 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  37.73 
 
 		 269 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  40.07 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  40 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  35.87 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  39.04 
 
 		 635 aa  178  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  39.04 
 
 		 635 aa  178  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  36.53 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  38.57 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  38.57 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  40.57 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  38.69 
 
 		 285 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  39.42 
 
 		 285 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  38.31 
 
 		 276 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  39.75 
 
 		 281 aa  175  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  38.37 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  40.41 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  40.41 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  40.41 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>