More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4745 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  100 
 
 
277 aa  565  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  68.54 
 
 
271 aa  387  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  67.05 
 
 
273 aa  384  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  63.5 
 
 
282 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  65.53 
 
 
272 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  61.8 
 
 
274 aa  364  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  61.8 
 
 
274 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  65.79 
 
 
271 aa  360  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  61.25 
 
 
273 aa  353  1e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  67.05 
 
 
273 aa  347  8e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  61.22 
 
 
271 aa  347  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  60 
 
 
269 aa  347  1e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  60.67 
 
 
281 aa  346  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  64.39 
 
 
279 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  61.78 
 
 
275 aa  341  5.999999999999999e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  59.26 
 
 
276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  59.04 
 
 
286 aa  338  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  57.2 
 
 
277 aa  335  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  57.66 
 
 
281 aa  334  1e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  59.36 
 
 
284 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  56.55 
 
 
274 aa  321  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  55.81 
 
 
274 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  57.14 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  54.09 
 
 
286 aa  310  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  54.28 
 
 
272 aa  308  5e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  61.23 
 
 
279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  54.14 
 
 
275 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  53.76 
 
 
275 aa  301  9e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  54.14 
 
 
275 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  51.88 
 
 
275 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  59.77 
 
 
278 aa  291  6e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  51.32 
 
 
265 aa  287  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  53.93 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  50 
 
 
276 aa  278  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.64 
 
 
555 aa  275  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  51.87 
 
 
689 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  50.71 
 
 
309 aa  269  5e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  50.91 
 
 
297 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  48.72 
 
 
297 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  47.58 
 
 
294 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  47.69 
 
 
303 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  48.3 
 
 
311 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  46.42 
 
 
288 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  48.5 
 
 
279 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  47.08 
 
 
301 aa  255  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  48.19 
 
 
297 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  49.05 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  46.27 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  46.54 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  49.22 
 
 
263 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  45.65 
 
 
303 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  46.54 
 
 
270 aa  248  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  43.73 
 
 
303 aa  247  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  44.61 
 
 
289 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  45.42 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  46.21 
 
 
618 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  47.14 
 
 
305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  47.91 
 
 
302 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  46.62 
 
 
269 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  48.12 
 
 
280 aa  237  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  46.24 
 
 
280 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  46.79 
 
 
623 aa  235  8e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  46.79 
 
 
303 aa  234  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  45.52 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  44.91 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  46.64 
 
 
606 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  45.05 
 
 
280 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  46.21 
 
 
640 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  46.74 
 
 
629 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  45.97 
 
 
277 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  44.15 
 
 
278 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  47.58 
 
 
626 aa  229  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  48.12 
 
 
282 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  43.48 
 
 
285 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  45.05 
 
 
293 aa  228  6e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  44.4 
 
 
630 aa  228  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  45.95 
 
 
278 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  44.78 
 
 
281 aa  225  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  43.12 
 
 
624 aa  225  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  45.9 
 
 
299 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  44.05 
 
 
276 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  44.05 
 
 
276 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  42.48 
 
 
281 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  48.18 
 
 
283 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  44.05 
 
 
276 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  43.07 
 
 
271 aa  223  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  43.77 
 
 
631 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  44.05 
 
 
276 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  45.71 
 
 
276 aa  221  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  45.71 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  44.05 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  45.71 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  43.21 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  43.65 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  42.65 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  43.01 
 
 
280 aa  218  7.999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  43.98 
 
 
621 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  44.53 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  42.91 
 
 
282 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  43.39 
 
 
252 aa  206  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>