More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17580 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  58.45 
 
 		 630 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  100 
 
 		 622 aa  1228    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  67.8 
 
 		 627 aa  803    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  59.84 
 
 		 629 aa  718    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  60.55 
 
 		 639 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  67.59 
 
 		 624 aa  796    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  60.03 
 
 		 624 aa  749    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  60.7 
 
 		 626 aa  719    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  56.56 
 
 		 614 aa  627  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  57.34 
 
 		 612 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  45.69 
 
 		 621 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  47.46 
 
 		 606 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  38.83 
 
 		 662 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  30.49 
 
 		 618 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  28.95 
 
 		 631 aa  263  8e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  31.42 
 
 		 689 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  30.14 
 
 		 635 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  30.14 
 
 		 635 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  29.35 
 
 		 623 aa  237  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  34.37 
 
 		 636 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  30.97 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  30.26 
 
 		 653 aa  228  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  27.16 
 
 		 640 aa  226  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  29.38 
 
 		 648 aa  207  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  41.16 
 
 		 282 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  43.87 
 
 		 271 aa  200  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  29.13 
 
 		 636 aa  199  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  41.2 
 
 		 286 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  41.18 
 
 		 273 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  31.03 
 
 		 668 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  28.79 
 
 		 668 aa  196  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  38.6 
 
 		 274 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  40.67 
 
 		 281 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  31.59 
 
 		 666 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  38.6 
 
 		 274 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  37.46 
 
 		 314 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  37.46 
 
 		 314 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  27.92 
 
 		 632 aa  193  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  40.65 
 
 		 277 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  28.09 
 
 		 632 aa  192  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  29.88 
 
 		 668 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  37.58 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  42.11 
 
 		 281 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  27.74 
 
 		 632 aa  191  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  41.18 
 
 		 276 aa  191  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  31.93 
 
 		 682 aa  189  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  41.45 
 
 		 281 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  38.75 
 
 		 271 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  42.67 
 
 		 319 aa  188  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  26.92 
 
 		 636 aa  187  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  45.49 
 
 		 279 aa  187  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  26.27 
 
 		 697 aa  187  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3753  transketolase  30.17 
 
 		 675 aa  186  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  39.1 
 
 		 277 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  40.99 
 
 		 303 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  27.71 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  28.24 
 
 		 665 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  39.5 
 
 		 286 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  38.67 
 
 		 269 aa  184  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  27.66 
 
 		 634 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  38.46 
 
 		 273 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  28.51 
 
 		 661 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  39.71 
 
 		 272 aa  183  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  30.53 
 
 		 668 aa  183  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  38.69 
 
 		 273 aa  183  8.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  28.42 
 
 		 660 aa  183  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.32 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  28.5 
 
 		 671 aa  183  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  41.4 
 
 		 313 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  29.14 
 
 		 636 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  35.58 
 
 		 311 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  38.52 
 
 		 275 aa  181  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  30.27 
 
 		 664 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  39.76 
 
 		 325 aa  180  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  35.39 
 
 		 306 aa  180  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  27.77 
 
 		 667 aa  179  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  29.08 
 
 		 663 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  36.76 
 
 		 272 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  38.06 
 
 		 312 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  38.29 
 
 		 273 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  28.16 
 
 		 684 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  27.77 
 
 		 667 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  27.77 
 
 		 667 aa  177  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  27.77 
 
 		 667 aa  177  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  29.76 
 
 		 662 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  27.77 
 
 		 667 aa  177  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  27.77 
 
 		 667 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  34.38 
 
 		 318 aa  177  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  27.77 
 
 		 667 aa  177  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  39.84 
 
 		 284 aa  177  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  39.17 
 
 		 315 aa  176  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  42.16 
 
 		 273 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  29.56 
 
 		 653 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  29.51 
 
 		 680 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  30.5 
 
 		 684 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  27.62 
 
 		 667 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  29.25 
 
 		 660 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  39.47 
 
 		 275 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  39.1 
 
 		 275 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  37.78 
 
 		 275 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>