More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2720 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  100 
 
 		 273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  67.65 
 
 		 277 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  65.93 
 
 		 276 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  65.93 
 
 		 286 aa  371  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  62.73 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  62.73 
 
 		 274 aa  351  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  57.79 
 
 		 273 aa  321  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  57.09 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  60.22 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  57.14 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  58.59 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  57.62 
 
 		 271 aa  311  7.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  56.6 
 
 		 279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  56.39 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  53.96 
 
 		 269 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  54.92 
 
 		 273 aa  297  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  53.56 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  51.8 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  54.55 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  52.79 
 
 		 274 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  56.25 
 
 		 273 aa  294  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  54.94 
 
 		 284 aa  291  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  51.33 
 
 		 281 aa  285  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  57.41 
 
 		 279 aa  285  5.999999999999999e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  50.18 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  53.01 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  51.5 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  51.88 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  50.75 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  52.81 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  49.25 
 
 		 272 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  48.44 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  49.82 
 
 		 689 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  55.77 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  49.25 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  48.54 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  49.63 
 
 		 276 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  46.93 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  49.28 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  46.85 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  46.93 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  43.77 
 
 		 303 aa  241  9e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  46.06 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  43.97 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  46.3 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  44.02 
 
 		 277 aa  231  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  45.23 
 
 		 305 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.9 
 
 		 555 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  45.7 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  42.8 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  45.49 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  45.7 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  41.95 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  44.36 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  45.7 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  45.31 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  45.31 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  45.14 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  43.56 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  43.61 
 
 		 278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  44.4 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  44.72 
 
 		 303 aa  225  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  46.69 
 
 		 280 aa  225  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  43.87 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  44.07 
 
 		 280 aa  221  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  45.8 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  43.45 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  40.23 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  43.85 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  41.13 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  43.82 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  45.23 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  45.23 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  41.83 
 
 		 269 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  44.81 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  42.65 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  38.89 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  42.75 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  41.35 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  44.06 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  41.6 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  44.16 
 
 		 285 aa  211  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  40.68 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  42.34 
 
 		 630 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  42.7 
 
 		 629 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  40.86 
 
 		 311 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  44.19 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  44.96 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  43.61 
 
 		 606 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  43.7 
 
 		 280 aa  205  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  43.9 
 
 		 277 aa  205  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  43.82 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  43.82 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  43.45 
 
 		 612 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  41.09 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  41.04 
 
 		 624 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  41.54 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  42.16 
 
 		 623 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  43.07 
 
 		 626 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  41.11 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>