More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2919 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  89.89 
 
 		 286 aa  520  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  79.56 
 
 		 276 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  78.81 
 
 		 274 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  78.07 
 
 		 274 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  67.65 
 
 		 273 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  63.06 
 
 		 271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  63.16 
 
 		 271 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  60.15 
 
 		 272 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  58.67 
 
 		 273 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  57.2 
 
 		 277 aa  335  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  63.16 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  60.75 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  56.73 
 
 		 282 aa  323  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  59.77 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  56.3 
 
 		 274 aa  318  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  55.93 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  56.44 
 
 		 269 aa  315  6e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  60.07 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  53.51 
 
 		 281 aa  312  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  53.96 
 
 		 286 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  52.59 
 
 		 281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  53.68 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  55.34 
 
 		 284 aa  298  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  59.62 
 
 		 278 aa  298  9e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  53.9 
 
 		 689 aa  293  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  53.79 
 
 		 275 aa  292  3e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  57.09 
 
 		 275 aa  291  5e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  57.36 
 
 		 279 aa  291  7e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  54.37 
 
 		 275 aa  291  9e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  52.65 
 
 		 275 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  53.41 
 
 		 275 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  52.65 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  48.92 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  49.1 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  50.89 
 
 		 309 aa  266  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  48.24 
 
 		 303 aa  261  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  47.69 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  48.26 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  49.09 
 
 		 297 aa  254  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  47.39 
 
 		 279 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  47.29 
 
 		 273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.2 
 
 		 555 aa  249  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  48.4 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  46.62 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  46.57 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  48.93 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  48.88 
 
 		 606 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  44.57 
 
 		 276 aa  242  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  45.49 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  43.66 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  49.43 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  45.68 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  48.13 
 
 		 280 aa  234  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  43.23 
 
 		 288 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  45.05 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  47.41 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  44.65 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  46.99 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  46.99 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  42.8 
 
 		 276 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  45.88 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  45.35 
 
 		 624 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  42.64 
 
 		 276 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  44.19 
 
 		 270 aa  228  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  41.95 
 
 		 289 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  45.69 
 
 		 282 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  42.41 
 
 		 276 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  42.41 
 
 		 276 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  42.8 
 
 		 276 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  43.46 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  42.41 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  45.28 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  45.13 
 
 		 293 aa  226  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  43.23 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  44.11 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  42.59 
 
 		 294 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  42.91 
 
 		 629 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  42.48 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  41.91 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  44.53 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  43.27 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  45.02 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  44.28 
 
 		 621 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  42.18 
 
 		 630 aa  216  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  44.6 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  43.68 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  41.76 
 
 		 281 aa  215  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  41.39 
 
 		 276 aa  215  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  43.2 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  43.2 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  43.64 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  41.57 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  42.8 
 
 		 276 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  43.27 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  41.67 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  42.42 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  41.42 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  41.39 
 
 		 640 aa  205  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  41.91 
 
 		 623 aa  205  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>