More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0172 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  100 
 
 		 273 aa  570  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  61.62 
 
 		 282 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  64.29 
 
 		 273 aa  358  6e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  61.25 
 
 		 277 aa  353  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  58.96 
 
 		 274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  58.96 
 
 		 274 aa  338  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  58.3 
 
 		 271 aa  332  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  58.11 
 
 		 271 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  58.71 
 
 		 272 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  57.4 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  59.62 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  57.14 
 
 		 281 aa  323  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  58.75 
 
 		 275 aa  322  6e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  53.76 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  57.62 
 
 		 281 aa  312  2.9999999999999996e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  57.09 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  58.87 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  56.75 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  54.92 
 
 		 273 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  53.58 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  52.65 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  54.14 
 
 		 272 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  52.65 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  52.83 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  51.89 
 
 		 265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  52.08 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  55.47 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  54.1 
 
 		 279 aa  270  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  51.07 
 
 		 297 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  50.37 
 
 		 275 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  49.63 
 
 		 275 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  50.37 
 
 		 275 aa  265  7e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  48.5 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  49.62 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  47.9 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  48.12 
 
 		 276 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  45.69 
 
 		 288 aa  251  7e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  48.87 
 
 		 279 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  47.55 
 
 		 269 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  47.37 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.36 
 
 		 555 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  47.74 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  47.1 
 
 		 263 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  47.17 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  46.47 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  46.99 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  46.44 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  46.82 
 
 		 689 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  43.38 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  46.69 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  43.45 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  46.69 
 
 		 277 aa  232  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  44.94 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  43.8 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  46.59 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  47.01 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  45.52 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  45.39 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  43.88 
 
 		 309 aa  226  2e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  44.2 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  46.32 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  45.42 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  43.02 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  42.12 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  45.45 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  45.86 
 
 		 640 aa  218  7.999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  43.98 
 
 		 624 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  40.89 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  43.98 
 
 		 618 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  44.89 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  44.44 
 
 		 621 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  44.58 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  43.56 
 
 		 282 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  44.98 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  44.98 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  43.28 
 
 		 606 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  42.16 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  38.66 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  41.76 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  44.58 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  40 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  43.23 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  43.77 
 
 		 623 aa  208  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  44.58 
 
 		 276 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  43.07 
 
 		 630 aa  208  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  41.8 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  41.8 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  40.29 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  41.61 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  41.8 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  42.48 
 
 		 629 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  43.46 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  43.92 
 
 		 280 aa  204  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  43.37 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  42.65 
 
 		 626 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  41 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  42.48 
 
 		 631 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  41.48 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  42.28 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  41.03 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>