More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1680 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  61.38 
 
 		 635 aa  766    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  73.9 
 
 		 618 aa  944    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  61.38 
 
 		 635 aa  766    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  55.18 
 
 		 631 aa  684    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  100 
 
 		 623 aa  1278    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  53.59 
 
 		 640 aa  665    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  47.07 
 
 		 648 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  43.67 
 
 		 653 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  32.75 
 
 		 624 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  34.1 
 
 		 689 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  30.88 
 
 		 630 aa  267  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  30.58 
 
 		 629 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  31.97 
 
 		 621 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  29.92 
 
 		 626 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  30.97 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  30.72 
 
 		 624 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  30.37 
 
 		 614 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  29.61 
 
 		 612 aa  247  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  47.94 
 
 		 272 aa  241  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  29.7 
 
 		 627 aa  240  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  45.82 
 
 		 274 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  45.82 
 
 		 274 aa  237  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  46.79 
 
 		 277 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  48.31 
 
 		 281 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  48.12 
 
 		 273 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  44.84 
 
 		 286 aa  234  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  47.92 
 
 		 282 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  46.42 
 
 		 269 aa  229  8e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  31.03 
 
 		 639 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  45.69 
 
 		 281 aa  229  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  28.39 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  45.86 
 
 		 275 aa  226  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  44.94 
 
 		 275 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  44.57 
 
 		 275 aa  223  8e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  44.57 
 
 		 275 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  47.27 
 
 		 275 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  44.49 
 
 		 271 aa  218  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  44.19 
 
 		 272 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.38 
 
 		 276 aa  216  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  44.57 
 
 		 297 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  43.23 
 
 		 279 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  43.91 
 
 		 271 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  45.28 
 
 		 271 aa  211  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  44.94 
 
 		 273 aa  210  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  28.29 
 
 		 656 aa  210  7e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  28.44 
 
 		 636 aa  209  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.77 
 
 		 273 aa  208  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  44.53 
 
 		 274 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  30.14 
 
 		 636 aa  207  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  29.35 
 
 		 622 aa  207  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  29.86 
 
 		 634 aa  206  8e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.44 
 
 		 286 aa  206  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  43.8 
 
 		 274 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  41.91 
 
 		 277 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  29.74 
 
 		 666 aa  204  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  46 
 
 		 284 aa  204  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  29.34 
 
 		 636 aa  203  9e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  29.97 
 
 		 665 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  29.58 
 
 		 661 aa  201  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  29.06 
 
 		 639 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  42.16 
 
 		 273 aa  200  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  29.39 
 
 		 679 aa  200  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  28.7 
 
 		 655 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  29.61 
 
 		 663 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  28.64 
 
 		 666 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  28.64 
 
 		 666 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  29.27 
 
 		 632 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  29.66 
 
 		 665 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.12 
 
 		 555 aa  196  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  29.02 
 
 		 633 aa  195  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  28.64 
 
 		 666 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  28.59 
 
 		 660 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  28.66 
 
 		 632 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  41.43 
 
 		 303 aa  193  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  29.07 
 
 		 632 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  37.99 
 
 		 299 aa  193  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  28.17 
 
 		 668 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0851  transketolase  27.69 
 
 		 660 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0166  transketolase  30.7 
 
 		 976 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.717678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  29.08 
 
 		 738 aa  191  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  28.92 
 
 		 663 aa  190  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  29.13 
 
 		 686 aa  189  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  41.11 
 
 		 275 aa  189  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  30 
 
 		 665 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  39.64 
 
 		 297 aa  189  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  29.85 
 
 		 665 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  29.36 
 
 		 662 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.21 
 
 		 297 aa  187  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  39.54 
 
 		 265 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  41.33 
 
 		 279 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  28.55 
 
 		 666 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  39.77 
 
 		 269 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  40.15 
 
 		 301 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  40.08 
 
 		 273 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  29.08 
 
 		 663 aa  184  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  38.97 
 
 		 280 aa  183  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  27.93 
 
 		 660 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  28.83 
 
 		 668 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  30.02 
 
 		 662 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  29.62 
 
 		 663 aa  181  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>