More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0245 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  55.25 
 
 
271 aa  298  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  55.09 
 
 
282 aa  296  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  53.76 
 
 
274 aa  291  6e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  54.86 
 
 
272 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  53.38 
 
 
274 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  53.96 
 
 
272 aa  288  6e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  51.32 
 
 
277 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  55.25 
 
 
275 aa  285  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  51.89 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  52.12 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  51.5 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  51.95 
 
 
275 aa  281  9e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  52.53 
 
 
273 aa  280  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  52.65 
 
 
275 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  51.52 
 
 
275 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  50.95 
 
 
269 aa  275  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  53.79 
 
 
275 aa  275  5e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  54.09 
 
 
273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  54.05 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  51.37 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  49.44 
 
 
275 aa  270  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  52.53 
 
 
271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  49.64 
 
 
286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  48.26 
 
 
286 aa  265  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  54.05 
 
 
278 aa  263  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  48.44 
 
 
273 aa  262  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  48.85 
 
 
276 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  48.66 
 
 
274 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  48.26 
 
 
277 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  51.78 
 
 
284 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  47.89 
 
 
274 aa  258  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  51.42 
 
 
689 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  48.46 
 
 
281 aa  252  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  49.63 
 
 
280 aa  252  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  47.76 
 
 
280 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  47.08 
 
 
263 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  44.53 
 
 
279 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  45.49 
 
 
274 aa  234  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  43.12 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  46.48 
 
 
278 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  42.34 
 
 
297 aa  229  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  41.06 
 
 
269 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  43.07 
 
 
309 aa  226  2e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  41.06 
 
 
269 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  43.61 
 
 
276 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  40.84 
 
 
302 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  46.12 
 
 
281 aa  224  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  45.35 
 
 
280 aa  223  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  44.78 
 
 
282 aa  222  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.16 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  41.06 
 
 
281 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  40.84 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  44.87 
 
 
293 aa  219  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  38.95 
 
 
288 aa  218  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  44.24 
 
 
281 aa  217  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  42.97 
 
 
278 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  44.14 
 
 
273 aa  216  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  42.91 
 
 
285 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  40.51 
 
 
303 aa  215  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  41.39 
 
 
303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.42 
 
 
555 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  40.07 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  44.4 
 
 
280 aa  211  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  43.8 
 
 
282 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  44.57 
 
 
276 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  43.54 
 
 
285 aa  208  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  42.98 
 
 
277 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.35 
 
 
297 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  42.01 
 
 
277 aa  205  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  43.17 
 
 
303 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  38.95 
 
 
283 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  41.03 
 
 
305 aa  203  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  42.06 
 
 
276 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  41.87 
 
 
276 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  42.06 
 
 
276 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  42.06 
 
 
276 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  40.49 
 
 
276 aa  201  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  43.58 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  37.6 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  42.26 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  38.08 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  41.87 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  41.87 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  41.87 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  42.47 
 
 
271 aa  199  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  42.53 
 
 
624 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  40.93 
 
 
267 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  41.46 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  38.61 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  40.15 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  40.62 
 
 
280 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  36.68 
 
 
294 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  39.15 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  42.21 
 
 
640 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  40.61 
 
 
621 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  39.69 
 
 
606 aa  188  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  39.54 
 
 
623 aa  185  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  40.91 
 
 
630 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  35.32 
 
 
285 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>