More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0287 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0287  transketolase  100 
 
 		 274 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  99.27 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  65.15 
 
 		 282 aa  381  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  62.96 
 
 		 271 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  65.66 
 
 		 273 aa  377  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  61.65 
 
 		 272 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  61.8 
 
 		 277 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  62.88 
 
 		 269 aa  361  7.0000000000000005e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  64.07 
 
 		 271 aa  360  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  59.26 
 
 		 271 aa  357  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  63.81 
 
 		 275 aa  353  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  61.42 
 
 		 281 aa  353  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  62.41 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  58.96 
 
 		 273 aa  338  5e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  58.43 
 
 		 279 aa  337  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  61.8 
 
 		 272 aa  330  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  55.76 
 
 		 286 aa  322  4e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  56.83 
 
 		 276 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  56.51 
 
 		 281 aa  319  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  58.57 
 
 		 284 aa  319  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  56.3 
 
 		 277 aa  318  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  56.67 
 
 		 286 aa  318  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  56.09 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  55.72 
 
 		 274 aa  315  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  55.06 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  55.43 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  54.31 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  53.56 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  53.38 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  55.93 
 
 		 278 aa  288  6e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  52.26 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  51.69 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  53.73 
 
 		 279 aa  282  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  50.19 
 
 		 689 aa  278  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  49.27 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  48.74 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.52 
 
 		 555 aa  268  5e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  48.15 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  48.55 
 
 		 273 aa  262  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  47.29 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  49.45 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  46.47 
 
 		 279 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  47.65 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  48.33 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  44.53 
 
 		 274 aa  254  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  53.11 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  46.52 
 
 		 297 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  46.67 
 
 		 301 aa  248  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  45.09 
 
 		 303 aa  248  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  45.52 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  47.31 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  45.99 
 
 		 281 aa  244  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  42.26 
 
 		 311 aa  244  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  45.93 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  48.21 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  43.56 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  46.27 
 
 		 280 aa  241  7.999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  45.22 
 
 		 606 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  44.4 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  46.67 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  45.82 
 
 		 623 aa  237  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  43.56 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  42.7 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  44.15 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  44.7 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  44.12 
 
 		 285 aa  234  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  46.74 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  46.3 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  41.73 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  44.94 
 
 		 282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  42.86 
 
 		 624 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  39.78 
 
 		 294 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  42.38 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  44 
 
 		 631 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  43.66 
 
 		 640 aa  230  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  39.85 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  42.38 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  42.38 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  42.38 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  41.73 
 
 		 278 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  47.27 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  45.7 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  42.01 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  43.01 
 
 		 630 aa  225  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  44.57 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  43.38 
 
 		 629 aa  225  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  43.66 
 
 		 618 aa  225  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  39.55 
 
 		 289 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  43.19 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  44.23 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  43.98 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  46.18 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  42.65 
 
 		 621 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  44.28 
 
 		 626 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  41.85 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  40.22 
 
 		 612 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  41.5 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  42.49 
 
 		 635 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  42.49 
 
 		 635 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  42.15 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>