More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4506 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_09180  conserved hypothetical protein  60.6 
 
 
640 aa  784    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00040  transketolase, putative  63.46 
 
 
673 aa  840    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.214798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4506  Transketolase domain protein  100 
 
 
637 aa  1316    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4061  Transketolase domain protein  77.86 
 
 
637 aa  1056    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0721  transketolase-like  74.69 
 
 
636 aa  1021    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953782  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  27.53 
 
 
635 aa  188  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  27.53 
 
 
635 aa  188  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  28.01 
 
 
640 aa  183  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  27.31 
 
 
653 aa  183  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  28.52 
 
 
648 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  26.8 
 
 
631 aa  160  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  27.24 
 
 
618 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  27.59 
 
 
623 aa  152  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  24.96 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  26.14 
 
 
592 aa  125  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  25.5 
 
 
621 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  26.04 
 
 
606 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  26.63 
 
 
629 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  25.13 
 
 
624 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  25.45 
 
 
626 aa  108  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  24.11 
 
 
630 aa  107  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  26.41 
 
 
689 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  26.03 
 
 
624 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  25.84 
 
 
653 aa  98.2  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  25.48 
 
 
627 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  30.04 
 
 
276 aa  91.3  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  24.87 
 
 
666 aa  90.5  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  27.93 
 
 
334 aa  89.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  32.43 
 
 
656 aa  89  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  28.17 
 
 
310 aa  89.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  27.96 
 
 
335 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  24.07 
 
 
312 aa  89.7  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  25.15 
 
 
340 aa  87  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  28.09 
 
 
338 aa  87  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  23.67 
 
 
639 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  22.52 
 
 
612 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  29.63 
 
 
276 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  29.63 
 
 
276 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  24.68 
 
 
662 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  23.26 
 
 
657 aa  85.5  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  29.63 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  26.86 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  23.92 
 
 
672 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  24.15 
 
 
661 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0874  transketolase  28.07 
 
 
663 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000542021  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  24.08 
 
 
666 aa  83.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  21.67 
 
 
662 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  24.76 
 
 
672 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  22.51 
 
 
664 aa  82.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  24.87 
 
 
665 aa  82.4  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  26.26 
 
 
330 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  29.79 
 
 
690 aa  82  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  26.27 
 
 
314 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  26.52 
 
 
342 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  23.99 
 
 
661 aa  82  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  28.06 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  28.74 
 
 
639 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  25.78 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  22.57 
 
 
636 aa  81.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  25.31 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  23.63 
 
 
636 aa  81.3  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  25 
 
 
660 aa  80.9  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  24.12 
 
 
661 aa  80.9  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  32.62 
 
 
711 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  24.77 
 
 
663 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29260  transketolase  25 
 
 
684 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.029788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  24.1 
 
 
670 aa  80.1  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  24.65 
 
 
663 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  22.93 
 
 
660 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  24.6 
 
 
672 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  28.06 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  24.43 
 
 
671 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  23.34 
 
 
661 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  30.42 
 
 
665 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  23.5 
 
 
680 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  23.01 
 
 
684 aa  79.7  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  25.68 
 
 
314 aa  79  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  24.03 
 
 
662 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  27.8 
 
 
634 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  32.38 
 
 
682 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  28.04 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  28.63 
 
 
636 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  29.48 
 
 
662 aa  78.6  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  29.39 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  27.97 
 
 
632 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  32.05 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 
687 aa  77.8  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  27.51 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0876  transketolase  24.77 
 
 
663 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  28.3 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  32.9 
 
 
691 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  32.9 
 
 
691 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  23.89 
 
 
622 aa  77.4  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  26.37 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  23.45 
 
 
671 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  21.64 
 
 
681 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  29.93 
 
 
665 aa  77.4  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  31.62 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  21.64 
 
 
681 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  21.14 
 
 
681 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>