More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4061 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_09180  conserved hypothetical protein  58.71 
 
 		 640 aa  775    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00040  transketolase, putative  60.66 
 
 		 673 aa  794    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.214798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4506  Transketolase domain protein  77.86 
 
 		 637 aa  1056    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0721  transketolase-like  79.09 
 
 		 636 aa  1077    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953782  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4061  Transketolase domain protein  100 
 
 		 637 aa  1320    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  29.04 
 
 		 635 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  29.04 
 
 		 635 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  28.75 
 
 		 653 aa  190  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  28.18 
 
 		 640 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  27.15 
 
 		 631 aa  155  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  27.03 
 
 		 618 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  26.47 
 
 		 648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  27.97 
 
 		 623 aa  150  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  26.76 
 
 		 689 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  25.5 
 
 		 621 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  25.17 
 
 		 624 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  26.15 
 
 		 592 aa  118  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  25.24 
 
 		 606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  24.95 
 
 		 630 aa  116  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  23.58 
 
 		 614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  26.15 
 
 		 629 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  25.52 
 
 		 626 aa  111  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  27.02 
 
 		 315 aa  99.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  24.29 
 
 		 612 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  29.04 
 
 		 276 aa  97.4  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  30.61 
 
 		 276 aa  97.4  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  30.61 
 
 		 276 aa  97.4  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  23.79 
 
 		 672 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  30.2 
 
 		 276 aa  95.5  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  29.62 
 
 		 310 aa  94  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  23.66 
 
 		 711 aa  94  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  28.05 
 
 		 334 aa  93.6  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  30.51 
 
 		 278 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  24.34 
 
 		 672 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  23.82 
 
 		 624 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2599  transketolase  22.99 
 
 		 672 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286494 
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  22.42 
 
 		 687 aa  90.5  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  24.67 
 
 		 672 aa  90.5  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  27.6 
 
 		 335 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  27.42 
 
 		 634 aa  89.4  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  24.76 
 
 		 656 aa  89  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  24.47 
 
 		 690 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  27.27 
 
 		 306 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  24.47 
 
 		 690 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  26.45 
 
 		 317 aa  88.6  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  24.26 
 
 		 662 aa  88.2  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  23.5 
 
 		 665 aa  87.8  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  23.73 
 
 		 627 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  24.54 
 
 		 312 aa  87  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  24.07 
 
 		 666 aa  87.4  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  24.19 
 
 		 690 aa  87  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  22.26 
 
 		 680 aa  87  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  26.71 
 
 		 314 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  23.67 
 
 		 633 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  26.5 
 
 		 339 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  26.5 
 
 		 339 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  21.51 
 
 		 657 aa  86.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  26.07 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  28.4 
 
 		 639 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  23.62 
 
 		 663 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  26.88 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  28.57 
 
 		 632 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  23.56 
 
 		 692 aa  85.1  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  21.79 
 
 		 664 aa  84.7  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  26.88 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  23.98 
 
 		 690 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  26.49 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  28.63 
 
 		 632 aa  84.3  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  26.49 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  28.63 
 
 		 632 aa  84  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  23.72 
 
 		 653 aa  84  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  26.49 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  24.27 
 
 		 622 aa  83.2  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  28.41 
 
 		 333 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  22.89 
 
 		 661 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  26.17 
 
 		 330 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  28.76 
 
 		 320 aa  83.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  22.98 
 
 		 670 aa  82.8  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  23 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  23 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  24.83 
 
 		 317 aa  82.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  23 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  29.73 
 
 		 665 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  26.72 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  27.14 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  26.72 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  25.49 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  23.48 
 
 		 661 aa  81.3  0.00000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  32.9 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  27.78 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  27.76 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  32.9 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  27.43 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  27.94 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0021  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  23.37 
 
 		 621 aa  80.5  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.640132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  26.13 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  28.46 
 
 		 282 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  24.23 
 
 		 332 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  22.56 
 
 		 665 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  24.57 
 
 		 665 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>