More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00040 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_09180  conserved hypothetical protein  64.89 
 
 		 640 aa  821    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00040  transketolase, putative  100 
 
 		 673 aa  1387    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.214798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4506  Transketolase domain protein  63.46 
 
 		 637 aa  840    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4061  Transketolase domain protein  60.66 
 
 		 637 aa  794    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0721  transketolase-like  59.78 
 
 		 636 aa  785    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953782  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  27.12 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  26.24 
 
 		 640 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  26.71 
 
 		 631 aa  167  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  28.32 
 
 		 618 aa  167  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  26.89 
 
 		 635 aa  164  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  26.89 
 
 		 635 aa  164  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  27.75 
 
 		 623 aa  162  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  26.3 
 
 		 648 aa  144  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  26.59 
 
 		 621 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  31.56 
 
 		 278 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  23.74 
 
 		 614 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  24.56 
 
 		 624 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  25.13 
 
 		 689 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  29.15 
 
 		 276 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  29.63 
 
 		 276 aa  97.4  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  29.63 
 
 		 276 aa  97.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  29.63 
 
 		 276 aa  97.4  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  25.14 
 
 		 592 aa  95.9  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  30.68 
 
 		 656 aa  94.7  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  24.67 
 
 		 612 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  23.78 
 
 		 626 aa  92.8  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  23.3 
 
 		 606 aa  91.3  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  26.05 
 
 		 622 aa  91.3  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  30.55 
 
 		 303 aa  91.3  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  28.68 
 
 		 690 aa  90.9  8e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  23.4 
 
 		 630 aa  90.5  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  23.76 
 
 		 629 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  29.28 
 
 		 315 aa  89.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  31.9 
 
 		 280 aa  88.6  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  30.08 
 
 		 282 aa  87.4  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  27.92 
 
 		 319 aa  87  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  32.86 
 
 		 274 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  27.6 
 
 		 634 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  28.38 
 
 		 277 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  32.86 
 
 		 274 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  29.25 
 
 		 636 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  31.98 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  31.42 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  27.96 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  28.46 
 
 		 636 aa  84.3  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  25.3 
 
 		 627 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  31.15 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  34.85 
 
 		 655 aa  84  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3263  hypothetical protein  34.85 
 
 		 663 aa  84  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.415108 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  29.81 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  32.08 
 
 		 273 aa  83.6  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  27.45 
 
 		 639 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  27.31 
 
 		 636 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  31.22 
 
 		 665 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1748  transketolase  29.7 
 
 		 675 aa  82.8  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1865  transketolase  29.51 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  28.4 
 
 		 633 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  27.6 
 
 		 252 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  29.47 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  29.12 
 
 		 662 aa  81.6  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0851  transketolase  28.68 
 
 		 660 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  26.51 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0874  transketolase  30.99 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000542021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  23.35 
 
 		 711 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  32.29 
 
 		 665 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  30 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0876  transketolase  30.99 
 
 		 663 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  30.86 
 
 		 653 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  28.98 
 
 		 665 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02341  transketolase  27.74 
 
 		 666 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.904862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0788  transketolase  30.99 
 
 		 663 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000527477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  35.5 
 
 		 282 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  29.26 
 
 		 274 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  29.26 
 
 		 274 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  29.11 
 
 		 263 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  31.84 
 
 		 665 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  27.49 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  26.8 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  29.12 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  26.37 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  29.47 
 
 		 664 aa  79  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  27.31 
 
 		 632 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  30.04 
 
 		 664 aa  79  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  25.38 
 
 		 624 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  27.49 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  23.25 
 
 		 660 aa  78.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  29.22 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  30.74 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  30.04 
 
 		 664 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  30.04 
 
 		 664 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  30.04 
 
 		 664 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  30.04 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  30.04 
 
 		 664 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  29.28 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  29.18 
 
 		 664 aa  77.8  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  28.09 
 
 		 687 aa  77.4  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  23.8 
 
 		 661 aa  77.4  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  33.93 
 
 		 664 aa  77.4  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0166  transketolase  26.05 
 
 		 976 aa  77.8  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.717678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  28.51 
 
 		 692 aa  77.4  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>