More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1748 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1748  transketolase  100 
 
 		 675 aa  1397    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  40.56 
 
 		 666 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  40.71 
 
 		 680 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  40.41 
 
 		 666 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  40.41 
 
 		 666 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  40.41 
 
 		 680 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  40.41 
 
 		 666 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  40.56 
 
 		 666 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  40.27 
 
 		 666 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  40.27 
 
 		 666 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  39.97 
 
 		 666 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  40.12 
 
 		 666 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  40.27 
 
 		 668 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  40.62 
 
 		 682 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  40.8 
 
 		 665 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1865  transketolase  41.08 
 
 		 657 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  39.23 
 
 		 662 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  40.06 
 
 		 660 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  39.59 
 
 		 661 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  40.79 
 
 		 667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  40.7 
 
 		 668 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  39.09 
 
 		 662 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  39.62 
 
 		 659 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  42.19 
 
 		 675 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  39.09 
 
 		 662 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  38.35 
 
 		 666 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  39.47 
 
 		 659 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  38.21 
 
 		 666 aa  436  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  38.21 
 
 		 666 aa  436  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  38.21 
 
 		 666 aa  438  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  39.76 
 
 		 665 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  40.18 
 
 		 672 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0851  transketolase  39.88 
 
 		 660 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  38.21 
 
 		 668 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  38.45 
 
 		 671 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  40.64 
 
 		 678 aa  435  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3753  transketolase  40.15 
 
 		 675 aa  435  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2214  transketolase  40.26 
 
 		 708 aa  432  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00287199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  38.23 
 
 		 667 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  39.76 
 
 		 665 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  39.29 
 
 		 697 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  39.76 
 
 		 663 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  38.62 
 
 		 665 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  39.44 
 
 		 662 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  40.27 
 
 		 658 aa  429  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  39.57 
 
 		 723 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  39.22 
 
 		 679 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  37.98 
 
 		 666 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  39.5 
 
 		 668 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  41.01 
 
 		 668 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  39.12 
 
 		 692 aa  425  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  38.13 
 
 		 665 aa  425  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  40.24 
 
 		 668 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  39.29 
 
 		 688 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  40.38 
 
 		 674 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  37.5 
 
 		 666 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  38.87 
 
 		 658 aa  421  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  38.64 
 
 		 665 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  39.32 
 
 		 653 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  35.94 
 
 		 661 aa  417  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  38.56 
 
 		 661 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  38.94 
 
 		 665 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  38.79 
 
 		 665 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  35.79 
 
 		 690 aa  413  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  38.6 
 
 		 661 aa  412  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  35.74 
 
 		 663 aa  415  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2974  transketolase  38.85 
 
 		 697 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  39.02 
 
 		 660 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  38.39 
 
 		 663 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  38.07 
 
 		 671 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  37.99 
 
 		 666 aa  415  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1980  transketolase  38.06 
 
 		 701 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543283  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  38.46 
 
 		 681 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  38.23 
 
 		 741 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  37.5 
 
 		 681 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  38.35 
 
 		 665 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  37.97 
 
 		 671 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  38.48 
 
 		 684 aa  412  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  38.27 
 
 		 664 aa  412  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2422  transketolase  38.21 
 
 		 695 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.635984 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0224  transketolase  38.17 
 
 		 673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  38.12 
 
 		 664 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  37.04 
 
 		 670 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  37.04 
 
 		 670 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  39.88 
 
 		 651 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  38.21 
 
 		 680 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  38.62 
 
 		 664 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  37.89 
 
 		 668 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  37.72 
 
 		 662 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  38.74 
 
 		 684 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  37.74 
 
 		 665 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  38.53 
 
 		 664 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  38.64 
 
 		 668 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  38.27 
 
 		 664 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  38.99 
 
 		 682 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  38.18 
 
 		 664 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  36.9 
 
 		 668 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  38.61 
 
 		 671 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0976  transketolase  39.24 
 
 		 664 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166447 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  37.94 
 
 		 662 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>