More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1865 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0851  transketolase  66.51 
 
 		 660 aa  895    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1865  transketolase  100 
 
 		 657 aa  1355    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  47.14 
 
 		 667 aa  547  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  45.05 
 
 		 666 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  45.2 
 
 		 666 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  45.05 
 
 		 680 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  45.2 
 
 		 666 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  44.89 
 
 		 680 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  44.83 
 
 		 666 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  45.05 
 
 		 666 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  45.05 
 
 		 666 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  44.89 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  45.05 
 
 		 666 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  44.28 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  44.97 
 
 		 668 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  45.22 
 
 		 662 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  45.22 
 
 		 662 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  44.44 
 
 		 662 aa  525  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  46.77 
 
 		 674 aa  528  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  47.04 
 
 		 665 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  45.17 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  47.04 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  44.26 
 
 		 711 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  45.41 
 
 		 668 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  45.35 
 
 		 680 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  46.65 
 
 		 682 aa  523  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  45.35 
 
 		 694 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  45.32 
 
 		 663 aa  519  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  45.11 
 
 		 660 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  46.4 
 
 		 678 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  44.7 
 
 		 666 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  43.41 
 
 		 665 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  44.9 
 
 		 661 aa  519  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  45.39 
 
 		 665 aa  521  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  46.3 
 
 		 658 aa  521  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  46.8 
 
 		 668 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  44.43 
 
 		 711 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  44.21 
 
 		 665 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  43.35 
 
 		 662 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  46.93 
 
 		 658 aa  517  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  46.05 
 
 		 655 aa  518  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  44.66 
 
 		 659 aa  514  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  43.63 
 
 		 662 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02341  transketolase  45.25 
 
 		 666 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.904862  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  44.66 
 
 		 664 aa  515  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  44.21 
 
 		 663 aa  512  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  44.51 
 
 		 659 aa  514  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  43.64 
 
 		 688 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  44.58 
 
 		 667 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  44.75 
 
 		 664 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  44.6 
 
 		 664 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  45.84 
 
 		 661 aa  511  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1034  transketolase  44.25 
 
 		 666 aa  508  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  43.7 
 
 		 664 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  44.68 
 
 		 665 aa  512  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  46.32 
 
 		 665 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  43.65 
 
 		 671 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  44.44 
 
 		 664 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  43.14 
 
 		 666 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  43.14 
 
 		 666 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  42.53 
 
 		 664 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  44.46 
 
 		 662 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0876  transketolase  42.77 
 
 		 663 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  43.9 
 
 		 666 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  43.52 
 
 		 665 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0910  transketolase  44.1 
 
 		 686 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  43.48 
 
 		 667 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  43.48 
 
 		 667 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  43.3 
 
 		 670 aa  503  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  43.48 
 
 		 667 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  42.07 
 
 		 666 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  43.53 
 
 		 664 aa  505  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  43.53 
 
 		 664 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  44.83 
 
 		 681 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  43.41 
 
 		 666 aa  502  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  43.64 
 
 		 667 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3228  transketolase  44.74 
 
 		 665 aa  502  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  45.29 
 
 		 675 aa  502  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  43.86 
 
 		 723 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  44.88 
 
 		 663 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  44.78 
 
 		 666 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  43.92 
 
 		 666 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  43.48 
 
 		 667 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  43.7 
 
 		 664 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  43.48 
 
 		 667 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  43.27 
 
 		 666 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  45.51 
 
 		 667 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  43.61 
 
 		 670 aa  502  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  43.48 
 
 		 667 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  44.36 
 
 		 668 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3659  transketolase  44.21 
 
 		 664 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  43.79 
 
 		 681 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  43.41 
 
 		 668 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  43.84 
 
 		 664 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  43.33 
 
 		 667 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  44.21 
 
 		 664 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4319  transketolase  44.04 
 
 		 666 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.658339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  42.4 
 
 		 680 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  43.84 
 
 		 664 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  42.75 
 
 		 671 aa  502  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>