More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3879 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  100 
 
 		 279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  50.75 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  51.89 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  56.13 
 
 		 271 aa  278  6e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  52.26 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  52.06 
 
 		 279 aa  275  8e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  54.78 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  50.36 
 
 		 297 aa  269  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  49.43 
 
 		 276 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  50.97 
 
 		 284 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  47.76 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  45.59 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  53.26 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  46.47 
 
 		 274 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  46.47 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  50 
 
 		 275 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  46.79 
 
 		 282 aa  258  8e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  47.21 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  49.25 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  48.5 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  47.39 
 
 		 277 aa  254  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  48.57 
 
 		 286 aa  254  8e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  46.18 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  47.39 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  52.75 
 
 		 279 aa  251  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  48.87 
 
 		 273 aa  249  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  45.49 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  45.11 
 
 		 274 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  51.35 
 
 		 302 aa  248  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  45.59 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  45.39 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  44.65 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  45.02 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  44.96 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  44.53 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  44.91 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  45.17 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  48.05 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.55 
 
 		 555 aa  229  4e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  44.66 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  45.28 
 
 		 689 aa  228  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  42.38 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  43.64 
 
 		 289 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  47.21 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  42.39 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  42.54 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  41.09 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  42.32 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  43.96 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  41.42 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  44.81 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  41.38 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  44 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  40.38 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  42.22 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  42.07 
 
 		 309 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  40.07 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  39.78 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  42.7 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  43.02 
 
 		 278 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  42.64 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  41.64 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  41.8 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  46.15 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  40 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  42.08 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  42.97 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  40 
 
 		 276 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  42.11 
 
 		 606 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  39.61 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  46.79 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  41.18 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  39.61 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  39.61 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  44.4 
 
 		 612 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  39.84 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  41.7 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  39.06 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  39.78 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  38.99 
 
 		 624 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  43.33 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  40.59 
 
 		 630 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  39.71 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  41.54 
 
 		 629 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  40.74 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  40.66 
 
 		 640 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  42.8 
 
 		 303 aa  191  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  39.77 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  43.82 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  40.22 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  39.48 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  40.56 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  40.07 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  41.13 
 
 		 274 aa  188  7e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  40.59 
 
 		 280 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  44.32 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  39.43 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  40.3 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  40.74 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  40.6 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>