More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0333 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  100 
 
 		 309 aa  633    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  51.82 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  55.11 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  51.71 
 
 		 286 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  49.64 
 
 		 274 aa  275  8e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  49.27 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  47.74 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  49.27 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  50.71 
 
 		 277 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  51.81 
 
 		 279 aa  268  8e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  52.14 
 
 		 276 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  50.89 
 
 		 277 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  48.03 
 
 		 272 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  48.19 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  49.82 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  50.36 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  48.39 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  48.76 
 
 		 275 aa  255  9e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  46.79 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  51.46 
 
 		 271 aa  252  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  48.54 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  46.79 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  46.43 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  48.67 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  48.29 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  49.28 
 
 		 273 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  46.91 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.93 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  46.1 
 
 		 281 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  44.6 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  49.1 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  47.08 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  45.94 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  43.92 
 
 		 689 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.88 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  45.99 
 
 		 297 aa  227  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  43.07 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  44.96 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  43.86 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  41.94 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  42.81 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  45.22 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  44.77 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  42.07 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  40.78 
 
 		 281 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  43.31 
 
 		 280 aa  205  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  41.09 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.3 
 
 		 555 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  44.8 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  41.01 
 
 		 624 aa  202  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  41.01 
 
 		 630 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  40.49 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  40.77 
 
 		 273 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  41.03 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  42.12 
 
 		 606 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  41.35 
 
 		 274 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  40.07 
 
 		 621 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  40.85 
 
 		 629 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  40.14 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  38.25 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  40.38 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  40.15 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  38.71 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  44.2 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  39.49 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  40.26 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  37.59 
 
 		 626 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  41.92 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  41.15 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  37.59 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  39.93 
 
 		 612 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  39.57 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  36.04 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  38.77 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  39.13 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  37.94 
 
 		 269 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  37.55 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.89 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  39.49 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  38.2 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  36.8 
 
 		 252 aa  179  7e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  39.19 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  38.93 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  42.28 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  34.6 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  39.85 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  38.57 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  37.17 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2109  transketolase domain-containing protein  42.51 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.337076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  38.14 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  39.53 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  37.07 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  38.27 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  39.49 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  38.77 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  38.77 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  38.83 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  38.77 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  38.35 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0790  transketolase domain-containing protein  41.77 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.931953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>