More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5276 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  84.64 
 
 		 282 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  74.25 
 
 		 281 aa  424  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  72.16 
 
 		 281 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  70.63 
 
 		 287 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  73.13 
 
 		 281 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  75.09 
 
 		 286 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  73.13 
 
 		 281 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  73.13 
 
 		 281 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  73.13 
 
 		 281 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  72.76 
 
 		 281 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  72.49 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  73.61 
 
 		 286 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  73.61 
 
 		 286 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6138  Transketolase domain protein  75.19 
 
 		 281 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  69.71 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  71.12 
 
 		 286 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  70.26 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  68.77 
 
 		 282 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  67.64 
 
 		 287 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3268  transketolase subunit A  71.22 
 
 		 282 aa  380  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.586745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  65.69 
 
 		 279 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  71.7 
 
 		 298 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  67.42 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  66.67 
 
 		 286 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  61.25 
 
 		 281 aa  361  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  63.4 
 
 		 307 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  61.48 
 
 		 281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  62.14 
 
 		 302 aa  354  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  64.44 
 
 		 293 aa  341  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  62.59 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2507  Transketolase domain protein  62.22 
 
 		 291 aa  284  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  49.26 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.82 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.91 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  42.7 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  43.07 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  42.59 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  41.85 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.67 
 
 		 274 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0900  transketolase domain-containing protein  45.19 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  41.04 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  42.96 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  41.22 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  39.93 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  43.82 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  41.13 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  42.7 
 
 		 303 aa  198  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  38.66 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  42.16 
 
 		 273 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  41.51 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  40.73 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  43.87 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  38.28 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  41.57 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  40.54 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  38.89 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  39.62 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  41.83 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  40.91 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  36.67 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  38.6 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  41.77 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  42.63 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  38.6 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  40.23 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  41.54 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  38.79 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  38.06 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  39.85 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  38.89 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  37.74 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  40.32 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  39.25 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  38.13 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  38.72 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  41.79 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  38.13 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  37.55 
 
 		 276 aa  175  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  42.46 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  38.27 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  38.14 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  35.32 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  37.36 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  33.94 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  40.94 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  33.58 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  37.21 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  37.69 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  33.58 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  35.04 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  38.49 
 
 		 689 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  38.27 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  38.27 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  38.27 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  33.21 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  33.82 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  36.08 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  42.06 
 
 		 303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>