More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2288 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  40.84 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  43.46 
 
 		 282 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  40.7 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  42.15 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  42.15 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  41.29 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  39.08 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5105  Transketolase domain protein  43.56 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  41.22 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  42.97 
 
 		 279 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  38.95 
 
 		 275 aa  201  9e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  38.95 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  41.92 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  41.35 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  39.25 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  38.46 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  40.7 
 
 		 273 aa  198  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  44.06 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  40.38 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  40.61 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  40.68 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  42.53 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  41 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  43.03 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  41.98 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  41.09 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  37.31 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  39.39 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  38.91 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  42.97 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  43.39 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  39.3 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  41.22 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  39.48 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  39.08 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  39.31 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  38.38 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  39.71 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  38.17 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  42.15 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.64 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.05 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  40.23 
 
 		 272 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  38.11 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  40.86 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  40.68 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  41.98 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  41.44 
 
 		 286 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  41.44 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  41.22 
 
 		 286 aa  185  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  39.03 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  38.46 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  39.77 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  38.04 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  40.68 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  38.77 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  36.33 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  40.77 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  39.54 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  39.67 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2514  transketolase subunit A  39.23 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  37.22 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  37.02 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  38.87 
 
 		 294 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  44.21 
 
 		 285 aa  178  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  39.16 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  39.16 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  39.54 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  39.38 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6138  Transketolase domain protein  39.16 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  38.31 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  38.2 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  37.84 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  38.11 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  37.8 
 
 		 624 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  36.5 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0181  transketolase subunit A  37.35 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  34.48 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  37.79 
 
 		 621 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  37.79 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  36.19 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  38.17 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  38.37 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  40.32 
 
 		 630 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  38.76 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  38.37 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  38.85 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  40.73 
 
 		 629 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  37.74 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  39.27 
 
 		 612 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  38.37 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  36.5 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  39.59 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  34.81 
 
 		 606 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>