More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1017 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  100 
 
 		 303 aa  627  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  78.22 
 
 		 303 aa  513  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  73.6 
 
 		 303 aa  489  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  81.19 
 
 		 305 aa  490  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  74.58 
 
 		 301 aa  474  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  70.95 
 
 		 297 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  70.3 
 
 		 303 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  50.71 
 
 		 280 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  48.93 
 
 		 277 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  49.29 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  49.83 
 
 		 285 aa  265  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  48.74 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  50.18 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  48.95 
 
 		 293 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  48.73 
 
 		 271 aa  262  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  48.75 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  50.58 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  47.81 
 
 		 279 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  49.29 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  48 
 
 		 272 aa  258  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  50.91 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  49.26 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  51.64 
 
 		 271 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  47.72 
 
 		 280 aa  256  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  46.79 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  49.27 
 
 		 273 aa  256  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  47.64 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  47.27 
 
 		 274 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  45.09 
 
 		 275 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  47.65 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  47.54 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  44.73 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  45.59 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  47.6 
 
 		 273 aa  245  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.48 
 
 		 281 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  44.72 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  44.73 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  45.29 
 
 		 274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  45.29 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  47.17 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  47.23 
 
 		 282 aa  240  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  44.77 
 
 		 689 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  44.85 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  42.65 
 
 		 281 aa  231  9e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  47.1 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  43.59 
 
 		 269 aa  230  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  42.01 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  43.33 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  44.2 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  44.32 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  41.54 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  41.88 
 
 		 606 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  39.78 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.43 
 
 		 555 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.4 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  41.67 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  36.88 
 
 		 276 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  41.89 
 
 		 280 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  35.95 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  41.42 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  39.15 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  39.26 
 
 		 278 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  40.22 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  38.55 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  36.95 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  42.06 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  38.87 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  38.32 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  38.93 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  37.27 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  36.56 
 
 		 274 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  36.33 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  37.13 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  38.55 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  38.55 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  38.08 
 
 		 618 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  38.49 
 
 		 623 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  38.81 
 
 		 278 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  41.5 
 
 		 279 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  40.54 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.18 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  37.98 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  39.08 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  36.07 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  40.32 
 
 		 279 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  36.45 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  39.06 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  37.28 
 
 		 621 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  37.91 
 
 		 630 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  38.1 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  35.5 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  40.98 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  39.93 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  36.36 
 
 		 263 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.6 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  36.75 
 
 		 640 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.2 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  37.64 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  37.28 
 
 		 629 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  39.44 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>