More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2127 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  100 
 
 		 276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  75.38 
 
 		 274 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  52.42 
 
 		 273 aa  281  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  50 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  50.19 
 
 		 279 aa  270  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  50.72 
 
 		 281 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  46.35 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  48.15 
 
 		 282 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  48.15 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  49.06 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  47.78 
 
 		 274 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  49.62 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  47.55 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  47.17 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  46.44 
 
 		 281 aa  258  8e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  50.2 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  49.63 
 
 		 273 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  48.12 
 
 		 273 aa  252  6e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  46.04 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  46.67 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  47.73 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  46.15 
 
 		 286 aa  248  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  46.57 
 
 		 286 aa  248  8e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  44.85 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  44.85 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  44.57 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  46.3 
 
 		 274 aa  241  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  45.39 
 
 		 276 aa  241  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  45.52 
 
 		 272 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  45.15 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  46.67 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  45.56 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  46.3 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  45.9 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  46.77 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  46.13 
 
 		 275 aa  234  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  45.56 
 
 		 275 aa  234  9e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  45.83 
 
 		 273 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  42.65 
 
 		 281 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  45.71 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  45.71 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  44.75 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  45.49 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  43.61 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  46.37 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  40.96 
 
 		 288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  43.75 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  46.62 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  41.89 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  43.12 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  43.07 
 
 		 689 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  44.81 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  41.06 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  41.42 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  42.8 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.94 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  39.29 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  43.31 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  40.15 
 
 		 303 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.01 
 
 		 555 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  40.81 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  41.8 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  41.73 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  41.67 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  38.11 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  41.38 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  35.82 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  38.71 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  37.01 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  37.27 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  41.51 
 
 		 630 aa  190  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  38.85 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  37.91 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  37.96 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  37.96 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  38.24 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.96 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  39.03 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  37.59 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  40.53 
 
 		 629 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  39.21 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  37.83 
 
 		 621 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  40.08 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  40.07 
 
 		 631 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  40 
 
 		 626 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  38.64 
 
 		 624 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  39.62 
 
 		 618 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  36.14 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  38.01 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5105  Transketolase domain protein  42.64 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  37.05 
 
 		 280 aa  178  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  37.32 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  37.55 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  38.96 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  36.88 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  38.46 
 
 		 280 aa  175  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  37.82 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  36.63 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>