More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2482 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  100 
 
 
276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  99.28 
 
 
276 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  99.28 
 
 
276 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  99.28 
 
 
276 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  98.91 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  88.04 
 
 
276 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  68.27 
 
 
277 aa  387  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  61.89 
 
 
271 aa  345  3e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  56.51 
 
 
285 aa  308  5e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.8 
 
 
286 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  43.82 
 
 
271 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  44.94 
 
 
284 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  45.6 
 
 
271 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  45.7 
 
 
273 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  42.38 
 
 
274 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  42.8 
 
 
277 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  42.01 
 
 
274 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  44.4 
 
 
271 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  41.85 
 
 
274 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  41.48 
 
 
274 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  42.65 
 
 
273 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  40.86 
 
 
276 aa  221  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  44.05 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  41.2 
 
 
272 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  43.15 
 
 
282 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  44.88 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  43.95 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  44.58 
 
 
275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  40.8 
 
 
281 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  45.24 
 
 
279 aa  208  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  44.58 
 
 
273 aa  208  8e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  43.68 
 
 
277 aa  205  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  40.87 
 
 
269 aa  203  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  37.59 
 
 
286 aa  203  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  42.8 
 
 
273 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  40 
 
 
279 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  41.87 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  39.43 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  38.6 
 
 
272 aa  199  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  44.49 
 
 
278 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  40.32 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  38.77 
 
 
291 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  41.7 
 
 
280 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  39.53 
 
 
275 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  40.24 
 
 
281 aa  195  6e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 
275 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  42.62 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  38.83 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  40.89 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  40.71 
 
 
689 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  38.6 
 
 
281 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  37.96 
 
 
276 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1776  transketolase domain-containing protein  41.13 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  38.74 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  39.59 
 
 
263 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.74 
 
 
555 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0790  transketolase domain-containing protein  43.33 
 
 
267 aa  182  6e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.931953  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  35.69 
 
 
289 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  37.94 
 
 
294 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2109  transketolase domain-containing protein  42.55 
 
 
268 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.337076  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  39.45 
 
 
279 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  38.34 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  39.36 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  37.45 
 
 
280 aa  178  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  38.31 
 
 
302 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.15 
 
 
281 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  37.74 
 
 
297 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  36.43 
 
 
274 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  38.37 
 
 
301 aa  175  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  38.04 
 
 
287 aa  175  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  38.49 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  37.89 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  37.75 
 
 
311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0893  transketolase subunit A  42.53 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  38 
 
 
303 aa  171  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  36.76 
 
 
280 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  39.83 
 
 
276 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  39.83 
 
 
276 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  39.83 
 
 
276 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  39.59 
 
 
268 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  35.37 
 
 
273 aa  168  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  38.19 
 
 
276 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  39.61 
 
 
278 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  38.28 
 
 
293 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  36.55 
 
 
303 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  36.05 
 
 
309 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  37.74 
 
 
281 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  37.98 
 
 
285 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  36.99 
 
 
303 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  41.6 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  33.6 
 
 
288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2656  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 
311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1629  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 
272 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 
274 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  41.67 
 
 
274 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 
274 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 
274 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1962  transketolase, N-terminal subunit  40.4 
 
 
274 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  36.05 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  35.04 
 
 
280 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>