More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A3183 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  100 
 
 
274 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  100 
 
 
274 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  100 
 
 
274 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  100 
 
 
274 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1629  transketolase, N-terminal subunit  100 
 
 
272 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2656  transketolase, N-terminal subunit  99.64 
 
 
311 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  99.27 
 
 
274 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1962  transketolase, N-terminal subunit  93.07 
 
 
274 aa  517  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  47.81 
 
 
271 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  42.8 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  50.21 
 
 
279 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  48.61 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  44.04 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  44.7 
 
 
263 aa  198  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  45.87 
 
 
297 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  41.95 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.91 
 
 
273 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  43.92 
 
 
272 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  43.13 
 
 
271 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  41.92 
 
 
274 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  41.92 
 
 
274 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  40.96 
 
 
286 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  40.22 
 
 
276 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  40.36 
 
 
273 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  43.28 
 
 
277 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  44.3 
 
 
284 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  40.46 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.3 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  41.15 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  40.3 
 
 
274 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  38.93 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  43.94 
 
 
277 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  44.81 
 
 
275 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  46.49 
 
 
279 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  43.72 
 
 
282 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  40.83 
 
 
272 aa  176  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  41.38 
 
 
270 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  42.15 
 
 
281 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  43.93 
 
 
281 aa  175  6e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  40.82 
 
 
277 aa  175  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  45.52 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  42.98 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  42.32 
 
 
271 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  42.21 
 
 
280 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  40 
 
 
275 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  42.21 
 
 
279 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  37.93 
 
 
275 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  39.49 
 
 
286 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  40.16 
 
 
278 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  42.75 
 
 
278 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  38.71 
 
 
265 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  39.59 
 
 
275 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  39.27 
 
 
271 aa  168  7e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.74 
 
 
555 aa  168  8e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  43.15 
 
 
297 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  41.9 
 
 
276 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  38.81 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  37.08 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  43.97 
 
 
302 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  41.67 
 
 
276 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  36.29 
 
 
252 aa  166  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  41.22 
 
 
276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  41.3 
 
 
311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  38.82 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  41.67 
 
 
276 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  42.44 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  41.27 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  41.27 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  41.27 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 
289 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  39.08 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  43.1 
 
 
280 aa  161  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  36.36 
 
 
275 aa  160  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5105  Transketolase domain protein  37.69 
 
 
275 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  39 
 
 
268 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  38.74 
 
 
630 aa  158  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  39.6 
 
 
291 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2514  transketolase subunit A  40.09 
 
 
269 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  37.92 
 
 
269 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  39.2 
 
 
303 aa  155  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  38.87 
 
 
280 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  40.65 
 
 
274 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  37.91 
 
 
303 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  38.52 
 
 
269 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  38.15 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  38.74 
 
 
624 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  41.91 
 
 
273 aa  151  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  39.52 
 
 
303 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  40 
 
 
301 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  43.28 
 
 
293 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  38.85 
 
 
286 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  40.34 
 
 
287 aa  148  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  40.33 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  37.8 
 
 
629 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  37.85 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  33.47 
 
 
285 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  37.84 
 
 
299 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0893  transketolase subunit A  40.25 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  39.62 
 
 
267 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  36.69 
 
 
282 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>