More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0615 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  100 
 
 		 268 aa  554  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  54.1 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  40.64 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  40.32 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  39.84 
 
 		 274 aa  191  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  37.98 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  45.64 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  39.44 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  39.62 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  39.04 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  40.23 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  38.04 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  40.64 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  37.97 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  36.57 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  38.76 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  39.75 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  37.59 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  36.43 
 
 		 294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  38.35 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  39.17 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  37.36 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  37.59 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  36.58 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  40.24 
 
 		 277 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  36.09 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  40 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  37.22 
 
 		 280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  37.69 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  35.32 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  36.57 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  35.07 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  37.97 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  36.09 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  38.72 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  33.58 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  42.02 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  38.35 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  34.94 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  39.1 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  35.56 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  37.83 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  35.56 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  35.93 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  36.09 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  34.46 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  34.08 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  36.55 
 
 		 281 aa  166  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  36.08 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  38.52 
 
 		 284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  33.46 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  33.46 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  38.06 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  36.23 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  35.23 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  33.58 
 
 		 281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  35.11 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  35.09 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.19 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  33.83 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  35.96 
 
 		 689 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  36.7 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  33.08 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  33.85 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  36.84 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  33.21 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  33.21 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  33.21 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  33.21 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  32.84 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  36.43 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  37.08 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  38.3 
 
 		 293 aa  158  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  34.07 
 
 		 302 aa  158  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  32.46 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  34.21 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  35.32 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  34.57 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  34.21 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0341  Transketolase domain protein  35.61 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  33.21 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  36.03 
 
 		 285 aa  155  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  33.83 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  36.36 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  35.8 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.92 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  38.15 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.64 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  38.15 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  38.15 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  38.15 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  38.15 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1629  transketolase, N-terminal subunit  38.15 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2656  transketolase, N-terminal subunit  38.15 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  37.04 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  37.9 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  36.56 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>