More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3957 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  93.93 
 
 		 307 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  70.97 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  69.12 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  66.18 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  62.5 
 
 		 282 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  65.2 
 
 		 286 aa  362  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  65.66 
 
 		 279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  60.84 
 
 		 282 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  61.19 
 
 		 285 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  63.77 
 
 		 286 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  61.73 
 
 		 287 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  62.77 
 
 		 285 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  63.77 
 
 		 286 aa  352  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  61.82 
 
 		 281 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  63.77 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  63.4 
 
 		 281 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  59.51 
 
 		 281 aa  346  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  62.26 
 
 		 286 aa  345  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  58.95 
 
 		 283 aa  345  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  60 
 
 		 287 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  62.64 
 
 		 281 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  62.26 
 
 		 281 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  62.26 
 
 		 281 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  62.26 
 
 		 282 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  59.73 
 
 		 286 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6138  Transketolase domain protein  63.02 
 
 		 281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  55.67 
 
 		 298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2507  Transketolase domain protein  63.48 
 
 		 291 aa  318  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  55.09 
 
 		 281 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  52.07 
 
 		 281 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3268  transketolase subunit A  59.86 
 
 		 282 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.586745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  48.09 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.4 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  43.82 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  41.39 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  40.96 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.78 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  40.78 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  40.6 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  43.95 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0900  transketolase domain-containing protein  43.3 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  45.34 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  41.22 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  41.57 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  42.23 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  41.7 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  41.87 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  43.36 
 
 		 273 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  36.26 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  42.06 
 
 		 279 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  36.2 
 
 		 280 aa  185  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  42.28 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  41.57 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  38.85 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  39.43 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  40.82 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  34.69 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  40.64 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  37.17 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  38.46 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  40.87 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  41.87 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  36.53 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  38.81 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  36.86 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  35.21 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  34.93 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  34.93 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  37.69 
 
 		 273 aa  173  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  35.83 
 
 		 277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  41.6 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  35.77 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.18 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  39.76 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  40.08 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  35.77 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  37.84 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  38.55 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  36.68 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  36.88 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  38.37 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  38.93 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  37.7 
 
 		 252 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  34.44 
 
 		 276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  36.09 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  38.79 
 
 		 276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  38.79 
 
 		 276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  34.57 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  38.79 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  41.22 
 
 		 278 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  34.07 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  34.07 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  43.32 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  34.07 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  34.2 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  34.1 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  38.52 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  36.11 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  38.03 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>