More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3268 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3268  transketolase subunit A  100 
 
 		 282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.586745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  81.85 
 
 		 282 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  79.18 
 
 		 281 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  77.62 
 
 		 281 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  77.62 
 
 		 281 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  77.22 
 
 		 281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  77.26 
 
 		 281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  76.51 
 
 		 281 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  77.53 
 
 		 283 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  75.44 
 
 		 281 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  72.4 
 
 		 282 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6138  Transketolase domain protein  79.1 
 
 		 281 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  74.35 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  71.22 
 
 		 282 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  73.98 
 
 		 286 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  70.82 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  73.61 
 
 		 286 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  72.43 
 
 		 287 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  73.03 
 
 		 279 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  68.35 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  71 
 
 		 279 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  73.23 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  69.43 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  70.63 
 
 		 286 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  70.41 
 
 		 298 aa  374  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  66.79 
 
 		 281 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  62.68 
 
 		 281 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  61.51 
 
 		 307 aa  341  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  59.86 
 
 		 302 aa  328  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  62.36 
 
 		 293 aa  318  9e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  57.09 
 
 		 284 aa  305  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2507  Transketolase domain protein  61.22 
 
 		 291 aa  275  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  45.53 
 
 		 278 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  43.56 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  44.15 
 
 		 276 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  43.94 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  43.18 
 
 		 286 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  41.73 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  43.77 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.19 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  42.05 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  42.26 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  39.39 
 
 		 274 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  39.02 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0900  transketolase domain-containing protein  45.21 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  42.4 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  45.27 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  41.51 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  39.63 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  40.68 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  39.62 
 
 		 279 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  42.17 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  39.07 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  40.32 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  40.73 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  39.85 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  42.74 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  40.82 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  40.52 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  40.46 
 
 		 689 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  36.67 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  41.32 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  41.98 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  39.77 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  40.47 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  42.04 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  37.69 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  40.08 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  39.92 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  40.73 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  38.93 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  38.74 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  41.37 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  36.06 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  36.95 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  41.95 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.88 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  40.89 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  41.18 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  36.58 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  36.9 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  36.58 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  36.74 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  38.98 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  43.62 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  36.64 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  36.58 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  37.14 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  36.19 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  36.19 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  35.61 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  36.4 
 
 		 276 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  36.19 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  37.74 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  35.09 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  38.52 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  39.41 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  36.29 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  35.2 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  35.09 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>