More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3642 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  83.63 
 
 		 281 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  65.93 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  65.57 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  65.31 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  65.57 
 
 		 287 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  65.31 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  67.03 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  63.44 
 
 		 281 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  65.3 
 
 		 281 aa  364  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  64.03 
 
 		 281 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  63.84 
 
 		 283 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  64.03 
 
 		 281 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  64.93 
 
 		 281 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  64.93 
 
 		 281 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  64.18 
 
 		 281 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  61.48 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  61.48 
 
 		 282 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  63.54 
 
 		 282 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  61.99 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  60.93 
 
 		 286 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6138  Transketolase domain protein  65.67 
 
 		 281 aa  341  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  61.76 
 
 		 279 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  59.78 
 
 		 285 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3268  transketolase subunit A  66.79 
 
 		 282 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.586745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  60.74 
 
 		 287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  59.48 
 
 		 298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  58.11 
 
 		 293 aa  305  8.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  53.79 
 
 		 307 aa  299  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  52.07 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  55.26 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2507  Transketolase domain protein  57.69 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  45.56 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  44.76 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  43.94 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  42.16 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  43.18 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  42.42 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  43.07 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.53 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  40.15 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  41.67 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  40.7 
 
 		 281 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  41.48 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  44.21 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  41.77 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  41.13 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  40.98 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  39.1 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  41.44 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  41.13 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0900  transketolase domain-containing protein  42.7 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  39.92 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  39.76 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  39.26 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  38.55 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  39.52 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  37.5 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  38.95 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  40.15 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  39.41 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  39.41 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  39.41 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  40.98 
 
 		 284 aa  181  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  42.8 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  38.71 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  40.59 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  39.69 
 
 		 275 aa  179  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  41.54 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  36.54 
 
 		 272 aa  177  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  39 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  41.57 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  39.11 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  34.88 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  36.54 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  36.54 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  36.46 
 
 		 291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  34.88 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  39 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  39.04 
 
 		 270 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  34.57 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  38.66 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  37.87 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  40.16 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  34.85 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  38.32 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  39.18 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  34.91 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  37.36 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  38.13 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  38.13 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  34.91 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  34.55 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  36.29 
 
 		 252 aa  169  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  36.12 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  38.43 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  34.7 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.74 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>