More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2690 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  98.91 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  98.91 
 
 		 276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  98.91 
 
 		 276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  98.91 
 
 		 276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  88.04 
 
 		 276 aa  501  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  68.63 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  62.26 
 
 		 271 aa  351  5.9999999999999994e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  56.51 
 
 		 285 aa  310  1e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.8 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  42.8 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  44.94 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  42.38 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  45.6 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  45.7 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  43.82 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  42.01 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  44.4 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  42.65 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  40.86 
 
 		 276 aa  225  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  44.05 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  41.85 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  41.48 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  45.28 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  41.2 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  45 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  41.18 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  45.63 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  43.95 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  44.58 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  40.8 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  40.87 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 286 aa  205  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  44.49 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  43.68 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  40 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  38.6 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  41.87 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  42.4 
 
 		 273 aa  201  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  39.43 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  40.32 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  40.64 
 
 		 281 aa  198  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  39.53 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 275 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  39.56 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  41.7 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  38.99 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  39.53 
 
 		 689 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  40.89 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  42.21 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  37.94 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  36.43 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  38.24 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  38.6 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  39.59 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.74 
 
 		 555 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  38.34 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  38.71 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  39.45 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  38.34 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1776  transketolase domain-containing protein  41.13 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  38.96 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.15 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0790  transketolase domain-containing protein  43.33 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.931953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  37.13 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  38.55 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  37.88 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  38.04 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  37.45 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  36.43 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  37.89 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2109  transketolase domain-containing protein  42.13 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.337076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  38.31 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  40.25 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  40.25 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  40.25 
 
 		 276 aa  175  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  38 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  38.58 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  38.1 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  36.78 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  39.61 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  39.59 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  35.37 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0893  transketolase subunit A  42.53 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  36.49 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  36.14 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  33.6 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2656  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653892  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  36.59 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  41.6 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  41.67 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1629  transketolase, N-terminal subunit  41.67 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  37.89 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  36.1 
 
 		 280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  37.35 
 
 		 285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  40.25 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>