More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3950 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  54.65 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  55.22 
 
 		 289 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  54.34 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  50.38 
 
 		 271 aa  258  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  51.21 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  47.92 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  48.09 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  48.21 
 
 		 273 aa  245  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  48.59 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  49 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  48.43 
 
 		 273 aa  238  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  46.59 
 
 		 271 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  46.06 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  44.91 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  44.29 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  50.79 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  44.98 
 
 		 272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  46.99 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  45.28 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  41.89 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  46.37 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  46.77 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  46.59 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  46.18 
 
 		 274 aa  222  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  46.69 
 
 		 275 aa  221  9e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  40.23 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  42.09 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  45.28 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  45.56 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  40.23 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  40.46 
 
 		 275 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  45.16 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  41.9 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  43.12 
 
 		 276 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  45.72 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  41.18 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  39.29 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  42.11 
 
 		 689 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  42.4 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  40.52 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  42.37 
 
 		 273 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.23 
 
 		 273 aa  209  6e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  45.6 
 
 		 278 aa  208  9e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  42.64 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  39.36 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  45.77 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  40.62 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  41.24 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  42.28 
 
 		 270 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  41.94 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  38.77 
 
 		 276 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  38.77 
 
 		 276 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  38.66 
 
 		 282 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  36.98 
 
 		 288 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.76 
 
 		 555 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  38.77 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  40 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  40.74 
 
 		 307 aa  195  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  39.15 
 
 		 265 aa  195  9e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  38.41 
 
 		 276 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  38.99 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  38.4 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  37.59 
 
 		 268 aa  192  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  40.83 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  40.8 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  39.04 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  38.15 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  35.56 
 
 		 269 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  37.45 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  36.4 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  37.97 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  40.84 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  36.19 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  38.93 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  38.93 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  38.93 
 
 		 276 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.69 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  35.66 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  39.85 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  35.66 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  40.08 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  40.4 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  35.82 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  39.61 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  37.22 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  42.08 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  40 
 
 		 301 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  36.07 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  38.38 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  39.67 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  39.92 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  35.77 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  36.43 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  40.54 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  40 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  38.57 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  39.77 
 
 		 630 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  38.52 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  35.53 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>