More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3529 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  93.26 
 
 		 267 aa  518  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  51.85 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  48.35 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  49.8 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  49.8 
 
 		 276 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  49.8 
 
 		 276 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  46.84 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  48.15 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  47.55 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  46.79 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  41.33 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  47.58 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  42.91 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  42.32 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  41.85 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  42.96 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  43.27 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  43.38 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.59 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  44.19 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  38.75 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  42.91 
 
 		 272 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  44.44 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  41.67 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  39.33 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  44.36 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  41.33 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  41.18 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  42.12 
 
 		 277 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  41.48 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  40.44 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  41.8 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  40.37 
 
 		 689 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  40.93 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  41.44 
 
 		 275 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  39.63 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  40.74 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  39.18 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  39.18 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  44.07 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  39.11 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  40 
 
 		 270 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  46.25 
 
 		 283 aa  194  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  40.7 
 
 		 274 aa  194  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  43.66 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  41.57 
 
 		 284 aa  192  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.79 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  42.28 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  38.93 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  39.7 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  40.81 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  42.37 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  40.74 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  38.55 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  38.55 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  36.19 
 
 		 288 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  40.68 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  40.4 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  41.04 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  40.15 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  39.13 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  39.21 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  43.82 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  40.44 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  36.76 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  40.15 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5105  Transketolase domain protein  38.11 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  37.55 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  38.15 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  37.13 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  37.91 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  37.5 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  37.99 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  38.19 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  36.54 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  36.59 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  37.36 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  39.77 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  38.43 
 
 		 606 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.48 
 
 		 555 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  38.43 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  38.46 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  36.36 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  38.65 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  39.27 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  37.36 
 
 		 630 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  35.23 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  36.16 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  40.42 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  37.6 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  35.82 
 
 		 624 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0341  Transketolase domain protein  38.82 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  38.43 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  36.8 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  36.88 
 
 		 629 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  36.86 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  36.59 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  34.08 
 
 		 618 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  36.07 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>