More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4990 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  100 
 
 
281 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  91.1 
 
 
281 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  91.46 
 
 
281 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  91.1 
 
 
281 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  91.1 
 
 
281 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  90.75 
 
 
281 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  87.23 
 
 
283 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  88.6 
 
 
281 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6138  Transketolase domain protein  86.94 
 
 
281 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  77.32 
 
 
282 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  72.36 
 
 
282 aa  427  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3268  transketolase subunit A  79.18 
 
 
282 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.586745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  72.16 
 
 
282 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  73.8 
 
 
285 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  73.06 
 
 
286 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  73.06 
 
 
286 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  73.06 
 
 
286 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  70.85 
 
 
287 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  72.43 
 
 
279 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  70.85 
 
 
286 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  70.57 
 
 
287 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  71.43 
 
 
298 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  69.53 
 
 
286 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  69.66 
 
 
279 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  70.94 
 
 
285 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  62.5 
 
 
281 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  63.44 
 
 
281 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  60.97 
 
 
307 aa  343  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  61.82 
 
 
302 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  64.04 
 
 
293 aa  330  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  61.85 
 
 
284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2507  Transketolase domain protein  60.95 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  45.14 
 
 
278 aa  225  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  45.9 
 
 
271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  42.44 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  41.09 
 
 
286 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  43.14 
 
 
271 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  41.73 
 
 
281 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  40.23 
 
 
273 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  42.86 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  39.85 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  39.85 
 
 
274 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  39.78 
 
 
286 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  43.94 
 
 
271 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  39.64 
 
 
277 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  39.78 
 
 
269 aa  193  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  41.04 
 
 
275 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  40.94 
 
 
273 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  40.98 
 
 
273 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  38.29 
 
 
282 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0900  transketolase domain-containing protein  43.21 
 
 
296 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  40.6 
 
 
279 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  42.11 
 
 
284 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  40.7 
 
 
275 aa  186  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.25 
 
 
297 aa  185  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  42.31 
 
 
303 aa  185  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  39.13 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  39.77 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  39.41 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  40.4 
 
 
279 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  41.37 
 
 
281 aa  181  8.000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  40.73 
 
 
274 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  40.73 
 
 
274 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  40.23 
 
 
297 aa  178  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  38.31 
 
 
277 aa  178  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  41.73 
 
 
303 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  35.07 
 
 
280 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  41.03 
 
 
279 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  41.13 
 
 
303 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  44.44 
 
 
278 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  36.53 
 
 
271 aa  176  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  39.75 
 
 
301 aa  175  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  35.09 
 
 
272 aa  175  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  38.27 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  36.51 
 
 
277 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  38.06 
 
 
270 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  37.78 
 
 
276 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  40.97 
 
 
689 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  39.41 
 
 
280 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  34.83 
 
 
291 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  37.69 
 
 
302 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  36.16 
 
 
285 aa  167  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  35.74 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  33.94 
 
 
273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  35.07 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  38.85 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  36.36 
 
 
280 aa  165  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  34.2 
 
 
288 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  37.04 
 
 
280 aa  165  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  37.9 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  34.23 
 
 
263 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  34.69 
 
 
281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  33.83 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  37.55 
 
 
252 aa  162  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  33.46 
 
 
275 aa  161  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  36.9 
 
 
276 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  41.94 
 
 
305 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  36.33 
 
 
297 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  37.22 
 
 
278 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  33.83 
 
 
275 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0144552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>