More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1712 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0900  transketolase domain-containing protein  66.17 
 
 		 296 aa  335  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  49.26 
 
 		 282 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  49.62 
 
 		 286 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  51.69 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  50.19 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  48.68 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  48.87 
 
 		 286 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  48.87 
 
 		 286 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  49.81 
 
 		 279 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  50 
 
 		 279 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  47.96 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  48.48 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  49.03 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  47.71 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  48.46 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  48.09 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  45.56 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  45.53 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  45.95 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  44.75 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  44.15 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  44.02 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6138  Transketolase domain protein  45.09 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  45.14 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  44.75 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  44.75 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  44.75 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  44.75 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  47.43 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  49.05 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  43.58 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3268  transketolase subunit A  45.53 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.586745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  42.32 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  41.39 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2507  Transketolase domain protein  47.78 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  40.81 
 
 		 273 aa  195  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  39.51 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  40.98 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  39.84 
 
 		 286 aa  191  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  38.67 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  41.35 
 
 		 271 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  40.82 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  40.45 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  40.08 
 
 		 279 aa  185  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  38.49 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  39.42 
 
 		 277 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  40.66 
 
 		 273 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  35.34 
 
 		 281 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  42.75 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  36.36 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  36.8 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  38.58 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  38.71 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  38.43 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  37.69 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  36.73 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  39.09 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  37.46 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  35.14 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  37.45 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  36.51 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  36.8 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  37.7 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  36.11 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  36.9 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  35.85 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  37.35 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  38.1 
 
 		 303 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  37.01 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  36.43 
 
 		 273 aa  168  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  36.4 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  38.52 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  37.25 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  37.25 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  37.25 
 
 		 276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  38.15 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  39.16 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  35.69 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  36.97 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  35.63 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  38.11 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  35.63 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  36.44 
 
 		 689 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  36.03 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  38.6 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  36.55 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.7 
 
 		 555 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  35.63 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  37.8 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  33.72 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  36.63 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  40.42 
 
 		 267 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  40 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  37.94 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  34.82 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  35.43 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  40 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  34.66 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  33.46 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>