More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00870 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  71.68 
 
 		 282 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  72.76 
 
 		 280 aa  424  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  69.78 
 
 		 281 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  65.83 
 
 		 280 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  62.68 
 
 		 285 aa  362  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  58.36 
 
 		 280 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  58.89 
 
 		 285 aa  318  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  51.94 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  49.48 
 
 		 303 aa  268  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  51.48 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  47.55 
 
 		 303 aa  256  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  48.97 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  51.05 
 
 		 305 aa  256  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  48.89 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  46.38 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  48.95 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  45.23 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  46.44 
 
 		 273 aa  239  5e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  47.04 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  48.51 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  46.47 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  47.23 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  49.63 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  46.3 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  44.72 
 
 		 286 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  44.65 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  46.3 
 
 		 274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  46.04 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  45.05 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  45.93 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  48.08 
 
 		 275 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  45.59 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  47.69 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  48.08 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  45.13 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  46.3 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  46.44 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  45.93 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.94 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.87 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  45.32 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  46.32 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  44.44 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  44.16 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  46.12 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  44.87 
 
 		 265 aa  219  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  44.62 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  42.81 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  41.11 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  39.8 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  40.74 
 
 		 689 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  40.74 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  38.85 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  40.44 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  37.59 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  37.41 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  39.13 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  40.44 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  36.9 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.46 
 
 		 555 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  42.98 
 
 		 280 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  35.9 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  35.56 
 
 		 606 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  35.45 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  37.16 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  39.6 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  38.24 
 
 		 631 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  37.41 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  37.65 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  37 
 
 		 621 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  38.24 
 
 		 623 aa  169  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  35.87 
 
 		 276 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  37.84 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  38.97 
 
 		 624 aa  168  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  37.5 
 
 		 618 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  37.28 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  37.05 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  36.96 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  36.59 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  35.66 
 
 		 640 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  33.81 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  36.4 
 
 		 276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  34.46 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  36 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  36.65 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  35.77 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  35.77 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  35.77 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  36.47 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  37.73 
 
 		 635 aa  159  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  37.73 
 
 		 635 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  34.72 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.55 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  34.35 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  37.8 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  37.55 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>