More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0341 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0341  Transketolase domain protein  100 
 
 		 288 aa  591  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  42.49 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  45.56 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  41.7 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  40.68 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  36.88 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  40.38 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  42.21 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  41.63 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  36.98 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  38.35 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  38.37 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  37.64 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  38.67 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  40.83 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  39.84 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  36.46 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  37.08 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  36.46 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  36.54 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  36.46 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  38.52 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  35.74 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  40.08 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  37.45 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  37.21 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  36.94 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  38.46 
 
 		 276 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  37.7 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  36.16 
 
 		 275 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  36.33 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  34.72 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  37.7 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  37.35 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  36.84 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  34.72 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  37.74 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  40.6 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  37.3 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  35.27 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  34.64 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  39.75 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  38.06 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  35.61 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  36.7 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  38.49 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  36.03 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  38.82 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  37.25 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  38.46 
 
 		 276 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  35.27 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  35.14 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  35.94 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  35.63 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  36.23 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  37.5 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  32.7 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  34.18 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  36.82 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  36.5 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  37.84 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  35.47 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  36.26 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  36.36 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  38.89 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  32.51 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  34.48 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  33.46 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  33.96 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  35.07 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  35.22 
 
 		 280 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  34.34 
 
 		 282 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  35.56 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  35.71 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  34.73 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0790  transketolase domain-containing protein  36.11 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.931953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  32.49 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  32.1 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  34.3 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  34.96 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  32.96 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  32.82 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  33.96 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  33.96 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1776  transketolase domain-containing protein  34.52 
 
 		 267 aa  142  9e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  32.71 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  34.88 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2109  transketolase domain-containing protein  34.12 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.337076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  32.71 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  32.71 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  33.06 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  31.62 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  34.31 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  36.4 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0893  transketolase subunit A  36.36 
 
 		 267 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  34.7 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  34.4 
 
 		 689 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>