More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1879 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  100 
 
 		 273 aa  557  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  76.64 
 
 		 274 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  46.95 
 
 		 592 aa  233  3e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  45.56 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1776  transketolase domain-containing protein  41.6 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  45.53 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2109  transketolase domain-containing protein  40.88 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.337076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  45.99 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  44.3 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  45.08 
 
 		 277 aa  198  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  43.32 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  41.43 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  42.51 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  43.83 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  42.35 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0790  transketolase domain-containing protein  40.68 
 
 		 267 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.931953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  46.69 
 
 		 273 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  44 
 
 		 271 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  40.4 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  39.55 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  40.86 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  46.12 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  42.51 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  39.84 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0893  transketolase subunit A  39.38 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  46.37 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  41.77 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  40.94 
 
 		 274 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.94 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  39.02 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  39.27 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  39.06 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  41.27 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  39.53 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  44.13 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  40.15 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  43.15 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  39.92 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  40.08 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  42.39 
 
 		 273 aa  175  9e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  42.34 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  35.79 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  35.63 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  40.89 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  39.76 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  38.89 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  37.12 
 
 		 280 aa  168  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  39.51 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  40.62 
 
 		 689 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  38.98 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  38.8 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  38.19 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  37.5 
 
 		 640 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  40.08 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  41.63 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  38.64 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  38.08 
 
 		 279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  37.79 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  37.25 
 
 		 626 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  38.28 
 
 		 624 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  38.65 
 
 		 618 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  38.1 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  35.8 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  39.83 
 
 		 270 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  37.36 
 
 		 285 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  38.89 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  36.88 
 
 		 629 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  36.95 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  37.65 
 
 		 630 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  37.55 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0341  Transketolase domain protein  39.75 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  38.43 
 
 		 606 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  38.58 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  40.64 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  35.97 
 
 		 623 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  40.64 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  40.64 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  37.77 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  34.98 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  34.14 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  34.84 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  39.51 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.23 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  39.26 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2514  transketolase subunit A  34.26 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  37.2 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  41.91 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2656  transketolase, N-terminal subunit  41.91 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  37.45 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1629  transketolase, N-terminal subunit  41.91 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  41.91 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  41.91 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  41.91 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  35.5 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  41.91 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  36.58 
 
 		 624 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  36.88 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  36.73 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  36.95 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>