More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1276 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  76.64 
 
 
273 aa  439  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  43.82 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2109  transketolase domain-containing protein  43.07 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.337076  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1776  transketolase domain-containing protein  42.37 
 
 
267 aa  211  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  44.49 
 
 
592 aa  211  9e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  43.75 
 
 
281 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0790  transketolase domain-containing protein  43.48 
 
 
267 aa  209  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.931953  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  43.02 
 
 
271 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0893  transketolase subunit A  41.47 
 
 
267 aa  207  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  43.32 
 
 
269 aa  206  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  43.02 
 
 
272 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  41.46 
 
 
272 aa  203  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  44.08 
 
 
279 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  44.83 
 
 
282 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  41.57 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  40.84 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  41.54 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.06 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  45.87 
 
 
273 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  41.38 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  41.87 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  39.01 
 
 
303 aa  196  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  41.3 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  43.62 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  39.54 
 
 
275 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.62 
 
 
273 aa  191  8e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  38.87 
 
 
271 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  43.55 
 
 
274 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  42.63 
 
 
284 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  43.55 
 
 
274 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  40.88 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  41.13 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  41.3 
 
 
274 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  37.28 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  41.13 
 
 
279 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  39.15 
 
 
303 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  44.53 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  37.97 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  37.99 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.54 
 
 
297 aa  178  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  37.17 
 
 
285 aa  178  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  36.43 
 
 
303 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  40.98 
 
 
263 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  41.13 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  40.24 
 
 
275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  38.43 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  38.22 
 
 
273 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  37.22 
 
 
640 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  36.63 
 
 
275 aa  170  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  36.2 
 
 
305 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  38.03 
 
 
265 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  40.54 
 
 
689 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  40.77 
 
 
252 aa  166  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  40.65 
 
 
278 aa  165  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  39.2 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  36.22 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  40 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  35.45 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  38.65 
 
 
280 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  36.48 
 
 
288 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  35.5 
 
 
281 aa  161  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  40.42 
 
 
271 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  38.76 
 
 
297 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  38.43 
 
 
267 aa  161  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  36 
 
 
293 aa  160  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  36.56 
 
 
303 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  37.55 
 
 
280 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  38.59 
 
 
299 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  34.08 
 
 
311 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  34.71 
 
 
268 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  36.15 
 
 
277 aa  158  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  33.46 
 
 
280 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1962  transketolase, N-terminal subunit  41.63 
 
 
274 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  35.36 
 
 
623 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  36.25 
 
 
270 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  35.36 
 
 
629 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  36.84 
 
 
630 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  33.94 
 
 
294 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  37.25 
 
 
278 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2656  transketolase, N-terminal subunit  40.65 
 
 
311 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1629  transketolase, N-terminal subunit  40.65 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788603  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  36.12 
 
 
280 aa  153  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  40.65 
 
 
274 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  40.65 
 
 
274 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  40.65 
 
 
274 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  40.65 
 
 
274 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  34.77 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.87 
 
 
555 aa  153  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  36.95 
 
 
277 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  40.24 
 
 
274 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  35.86 
 
 
614 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  38.25 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  35.46 
 
 
606 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  35.41 
 
 
618 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  33.96 
 
 
285 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  37.7 
 
 
278 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  35.46 
 
 
626 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0341  Transketolase domain protein  36.82 
 
 
288 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.18215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>