More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0048 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  585  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  75.63 
 
 		 280 aa  444  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  71.68 
 
 		 293 aa  430  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  70.57 
 
 		 281 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  66.31 
 
 		 285 aa  374  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  61.65 
 
 		 280 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  58.7 
 
 		 280 aa  337  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  64.47 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  47.78 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  47.08 
 
 		 303 aa  242  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  45.99 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  47.43 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  45.19 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  45.52 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  44.57 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  44.57 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  47.04 
 
 		 272 aa  224  9e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  45.99 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  44.78 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  42.91 
 
 		 275 aa  220  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  46.74 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  47.23 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  46.3 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  44.16 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  44.49 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  45.59 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  41.55 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  44.4 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  44.44 
 
 		 282 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  42.91 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  43.38 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  44.23 
 
 		 284 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  43.38 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.86 
 
 		 286 aa  208  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  44.11 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  45.35 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  42.07 
 
 		 269 aa  208  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  42.01 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  43.54 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  43.07 
 
 		 281 aa  205  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  42.65 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  43.38 
 
 		 274 aa  205  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  43.38 
 
 		 274 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  43.51 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  42.58 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  41.7 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  41.04 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  40.82 
 
 		 277 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  40.38 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  40.15 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  38.55 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  40.29 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  38.6 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  38.01 
 
 		 689 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.96 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  37.82 
 
 		 276 aa  175  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  35.9 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.06 
 
 		 555 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  38.83 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  36.8 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  40.29 
 
 		 623 aa  169  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  34.93 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  38.95 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  40.85 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  37.08 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  39.05 
 
 		 618 aa  163  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  37.88 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  37.36 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  33.7 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  38.79 
 
 		 297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  35.32 
 
 		 606 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  36.5 
 
 		 624 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  36.1 
 
 		 631 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  35.61 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  34.34 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  36.53 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  37.05 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  36.26 
 
 		 640 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  35.25 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  38.37 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  34.05 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  35.98 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  34.77 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  36.84 
 
 		 282 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  37.96 
 
 		 285 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  32.71 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  35.1 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  32.06 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  35.86 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  36.84 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  33.94 
 
 		 621 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  35.77 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  36.44 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  36.44 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  37.08 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  35.43 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  36.84 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  36.14 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  35.37 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>