101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3265 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 319 aa  614  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  67.09 
 
 		 327 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  62.97 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  60.13 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  55.73 
 
 		 326 aa  321  9.000000000000001e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  57.19 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  55.41 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  60.32 
 
 		 346 aa  315  5e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  55.03 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  52.88 
 
 		 329 aa  308  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  53.5 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  54.75 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  46.03 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  46.35 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  53.53 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  57 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  48.72 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  48.57 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  47.28 
 
 		 334 aa  242  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  46.42 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  46.47 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  46.82 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  46.82 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  46.82 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  42.04 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  48.24 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  43 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  46.1 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  45.17 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  44.9 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  48.05 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  40.45 
 
 		 317 aa  212  7.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  45.11 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  41.01 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  39.62 
 
 		 339 aa  185  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  39.13 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  33.76 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  32.35 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  27.22 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.73 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.47 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  27.54 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  28.01 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.92 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.17 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  27.59 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.02 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  23 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  26.82 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  33.57 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  26.6 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  21.73 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  28.82 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  29.44 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  27.86 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.67 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  22.74 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.67 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.62 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.62 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.62 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.62 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.6 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  19.08 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.62 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.62 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.62 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.02 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  24.89 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  27.73 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  20.69 
 
 		 333 aa  49.7  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  25.69 
 
 		 374 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  28.15 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  31.43 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  26.2 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  26.2 
 
 		 345 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2742  DNA polymerase III subunit delta  28.85 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  26.2 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.16 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25.9 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  23.2 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2571  DNA polymerase III subunit delta  30.53 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225423  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.21 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  21.39 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  26.75 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2981  DNA polymerase III subunit delta  30.22 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  21.52 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  23.63 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  20 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  26.74 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  27.91 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  26.09 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.47 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  27.44 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  16.26 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>