64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3523 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  617  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  99.69 
 
 
320 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  99.69 
 
 
320 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  87.5 
 
 
319 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  85.94 
 
 
316 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  79.23 
 
 
322 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  60.5 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  58.52 
 
 
324 aa  309  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  53.8 
 
 
326 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  55.41 
 
 
322 aa  285  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  47.76 
 
 
326 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  48.4 
 
 
329 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  47.92 
 
 
319 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  46.91 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  45.13 
 
 
330 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  46.82 
 
 
319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  44.05 
 
 
325 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  44.66 
 
 
327 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  44.73 
 
 
320 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  43.01 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  44.73 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  44.44 
 
 
334 aa  185  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  39.35 
 
 
317 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  37.42 
 
 
317 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  37.97 
 
 
330 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  39.75 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  42.02 
 
 
310 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  38.1 
 
 
342 aa  169  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  44.59 
 
 
333 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  40.91 
 
 
339 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  36.66 
 
 
317 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  37.03 
 
 
334 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  35.99 
 
 
330 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  35.65 
 
 
339 aa  145  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  36.1 
 
 
343 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  30.89 
 
 
328 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  30.57 
 
 
323 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  28.02 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.23 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.05 
 
 
348 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  22.98 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.58 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  24.43 
 
 
336 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.86 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  21.97 
 
 
325 aa  53.1  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.86 
 
 
336 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.86 
 
 
336 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  23.86 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  24.26 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  23.86 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  23.86 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 
331 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  23.86 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24.28 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 
312 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.67 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  29.33 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  20.18 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.48 
 
 
330 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  25.28 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0462  DNA polymerase III, delta subunit superfamily protein  27.61 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0321349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  22.3 
 
 
338 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  23.51 
 
 
344 aa  42.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>