86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2104 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 333 aa  631  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  77.34 
 
 		 334 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  56.55 
 
 		 319 aa  315  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  49.69 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  48.73 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  51.44 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  48.89 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  46.6 
 
 		 325 aa  262  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  50.31 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  49.24 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  49.68 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  46.2 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  44.58 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  50.48 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  43.83 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  44.84 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  44.84 
 
 		 320 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  44.84 
 
 		 320 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  44.52 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  41.64 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  41.46 
 
 		 317 aa  209  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  44.52 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  44.23 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  40.32 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  43.27 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  40.32 
 
 		 317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  43.17 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  44.34 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  39.94 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  42.55 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  40.91 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  42.22 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  45.39 
 
 		 310 aa  169  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  37.46 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  41.19 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  35.2 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  32.51 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.01 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.78 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.48 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.46 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  27.27 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.47 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  26.27 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.83 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  24.9 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  30.64 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  25.39 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.34 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.34 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.34 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.18 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  29.26 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.34 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  21.84 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  21.84 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  21.84 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  21.84 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  21.84 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.71 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  24.71 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.61 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.15 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  26.96 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  29.53 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  20.25 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  23.69 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.58 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  27.15 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  29.67 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  20.54 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  25.82 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  28.24 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  24.8 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  22.69 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  26.03 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  25.77 
 
 		 796 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.37 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  19.92 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  23.9 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  23.58 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.52 
 
 		 570 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>