83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1980 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  82.22 
 
 		 317 aa  527  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  55.52 
 
 		 334 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  53.87 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  53.85 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  54.37 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  50.96 
 
 		 339 aa  285  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  49.36 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  47.44 
 
 		 343 aa  269  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  45.22 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  42.67 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  42.04 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  42.41 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  41.07 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  44.23 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  43.4 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  43.71 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  44.55 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  41.16 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  41.1 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  39.61 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  36.77 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  37.78 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  38.11 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  38.11 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  38.11 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  39.12 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  39.35 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  38.1 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  38.66 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  34.98 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  36.89 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  32.69 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  38.51 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  40.26 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  31.23 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  34.7 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  27.88 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.11 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.35 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  31.15 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.37 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  29.73 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  25.81 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  27.64 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  27.87 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  24 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.59 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  24.5 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  27.66 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  27.72 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.56 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.87 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  21.02 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  21.02 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  27.67 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  21.02 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  25.85 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  21.28 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.23 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  20.43 
 
 		 343 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  27.24 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  25.3 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  22.87 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  22.01 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  22.14 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  24.9 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  25.9 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  24.9 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  26.27 
 
 		 345 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22.89 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  20.25 
 
 		 341 aa  42.4  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>