39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0729 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  692    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  25.79 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  27.32 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  22.49 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  22.4 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0462  DNA polymerase III, delta subunit superfamily protein  24.37 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0321349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  23.15 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  21 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.29 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.23 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  21.25 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  21.04 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  24.5 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  20.12 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  22.08 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  20.38 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  19.93 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  18.9 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  23.65 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  21.65 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  21.11 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  29.06 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.43 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  21.31 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  23.33 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  21.34 
 
 		 336 aa  46.2  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  24.88 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  24.88 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  20.44 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0476  DNA polymerase III subunit delta  24.15 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.159232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  32.53 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  21.63 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  20.93 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  22.28 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  22.37 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  19.45 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  18.6 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  21.2 
 
 		 346 aa  42.7  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>